Protein–RNA interactions for Protein: O88327

Ctnnal1, Alpha-catulin, mousemouse

Predictions only

Length 731 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnal1O88327 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ctnnal1O88327 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ctnnal1O88327 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ctnnal1O88327 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ctnnal1O88327 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ctnnal1O88327 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Ctnnal1O88327 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Ctnnal1O88327 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Ctnnal1O88327 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ctnnal1O88327 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ctnnal1O88327 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ctnnal1O88327 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ctnnal1O88327 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ctnnal1O88327 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ctnnal1O88327 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ctnnal1O88327 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ctnnal1O88327 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ctnnal1O88327 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ctnnal1O88327 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ctnnal1O88327 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ctnnal1O88327 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Ctnnal1O88327 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ctnnal1O88327 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ctnnal1O88327 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ctnnal1O88327 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ctnnal1O88327 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ctnnal1O88327 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ctnnal1O88327 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ctnnal1O88327 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ctnnal1O88327 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ctnnal1O88327 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ctnnal1O88327 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ctnnal1O88327 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Ctnnal1O88327 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ctnnal1O88327 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ctnnal1O88327 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ctnnal1O88327 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ctnnal1O88327 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ctnnal1O88327 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ctnnal1O88327 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ctnnal1O88327 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ctnnal1O88327 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ctnnal1O88327 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ctnnal1O88327 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ctnnal1O88327 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ctnnal1O88327 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Ctnnal1O88327 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ctnnal1O88327 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ctnnal1O88327 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ctnnal1O88327 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ctnnal1O88327 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ctnnal1O88327 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ctnnal1O88327 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Ctnnal1O88327 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Ctnnal1O88327 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ctnnal1O88327 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ctnnal1O88327 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ctnnal1O88327 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ctnnal1O88327 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ctnnal1O88327 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ctnnal1O88327 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ctnnal1O88327 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ctnnal1O88327 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ctnnal1O88327 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ctnnal1O88327 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ctnnal1O88327 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ctnnal1O88327 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ctnnal1O88327 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ctnnal1O88327 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ctnnal1O88327 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ctnnal1O88327 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ctnnal1O88327 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ctnnal1O88327 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ctnnal1O88327 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ctnnal1O88327 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ctnnal1O88327 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Ctnnal1O88327 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ctnnal1O88327 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ctnnal1O88327 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ctnnal1O88327 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ctnnal1O88327 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ctnnal1O88327 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Ctnnal1O88327 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ctnnal1O88327 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ctnnal1O88327 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ctnnal1O88327 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ctnnal1O88327 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ctnnal1O88327 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ctnnal1O88327 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ctnnal1O88327 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ctnnal1O88327 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ctnnal1O88327 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ctnnal1O88327 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ctnnal1O88327 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ctnnal1O88327 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ctnnal1O88327 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ctnnal1O88327 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ctnnal1O88327 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ctnnal1O88327 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ctnnal1O88327 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.7 ms