Protein–RNA interactions for Protein: O70456

Sfn, 14-3-3 protein sigma, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 248 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SfnO70456 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SfnO70456 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SfnO70456 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SfnO70456 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SfnO70456 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SfnO70456 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SfnO70456 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SfnO70456 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SfnO70456 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SfnO70456 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SfnO70456 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SfnO70456 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SfnO70456 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SfnO70456 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SfnO70456 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SfnO70456 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SfnO70456 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SfnO70456 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SfnO70456 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SfnO70456 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SfnO70456 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SfnO70456 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SfnO70456 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SfnO70456 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SfnO70456 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SfnO70456 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SfnO70456 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SfnO70456 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SfnO70456 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SfnO70456 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SfnO70456 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SfnO70456 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SfnO70456 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SfnO70456 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SfnO70456 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SfnO70456 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SfnO70456 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SfnO70456 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SfnO70456 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SfnO70456 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SfnO70456 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SfnO70456 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SfnO70456 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SfnO70456 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SfnO70456 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SfnO70456 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SfnO70456 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SfnO70456 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SfnO70456 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SfnO70456 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SfnO70456 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SfnO70456 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SfnO70456 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SfnO70456 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SfnO70456 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SfnO70456 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SfnO70456 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SfnO70456 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SfnO70456 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SfnO70456 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SfnO70456 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SfnO70456 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SfnO70456 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SfnO70456 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SfnO70456 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SfnO70456 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SfnO70456 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SfnO70456 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SfnO70456 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SfnO70456 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SfnO70456 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SfnO70456 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SfnO70456 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SfnO70456 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SfnO70456 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SfnO70456 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SfnO70456 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SfnO70456 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SfnO70456 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SfnO70456 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SfnO70456 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SfnO70456 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SfnO70456 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SfnO70456 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SfnO70456 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SfnO70456 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SfnO70456 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SfnO70456 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SfnO70456 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SfnO70456 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SfnO70456 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
SfnO70456 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SfnO70456 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SfnO70456 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SfnO70456 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SfnO70456 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SfnO70456 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SfnO70456 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SfnO70456 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SfnO70456 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms