Protein–RNA interactions for Protein: O55241

Hcrt, Orexin, mousemouse

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Length 130 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HcrtO55241 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HcrtO55241 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
HcrtO55241 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HcrtO55241 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HcrtO55241 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HcrtO55241 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HcrtO55241 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HcrtO55241 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HcrtO55241 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HcrtO55241 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HcrtO55241 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HcrtO55241 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HcrtO55241 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HcrtO55241 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HcrtO55241 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HcrtO55241 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HcrtO55241 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
HcrtO55241 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HcrtO55241 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HcrtO55241 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HcrtO55241 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HcrtO55241 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HcrtO55241 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HcrtO55241 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HcrtO55241 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
HcrtO55241 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HcrtO55241 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HcrtO55241 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HcrtO55241 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HcrtO55241 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HcrtO55241 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HcrtO55241 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HcrtO55241 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HcrtO55241 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HcrtO55241 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HcrtO55241 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HcrtO55241 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HcrtO55241 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HcrtO55241 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HcrtO55241 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HcrtO55241 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HcrtO55241 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HcrtO55241 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HcrtO55241 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HcrtO55241 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HcrtO55241 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HcrtO55241 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HcrtO55241 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HcrtO55241 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
HcrtO55241 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
HcrtO55241 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HcrtO55241 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HcrtO55241 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HcrtO55241 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HcrtO55241 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HcrtO55241 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HcrtO55241 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HcrtO55241 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HcrtO55241 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HcrtO55241 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HcrtO55241 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HcrtO55241 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HcrtO55241 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HcrtO55241 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
HcrtO55241 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HcrtO55241 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HcrtO55241 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HcrtO55241 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HcrtO55241 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HcrtO55241 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HcrtO55241 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HcrtO55241 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
HcrtO55241 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HcrtO55241 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HcrtO55241 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HcrtO55241 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HcrtO55241 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HcrtO55241 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
HcrtO55241 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HcrtO55241 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HcrtO55241 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
HcrtO55241 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HcrtO55241 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HcrtO55241 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HcrtO55241 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HcrtO55241 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HcrtO55241 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HcrtO55241 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HcrtO55241 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HcrtO55241 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HcrtO55241 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HcrtO55241 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HcrtO55241 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HcrtO55241 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HcrtO55241 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HcrtO55241 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HcrtO55241 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HcrtO55241 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HcrtO55241 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HcrtO55241 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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