Protein–RNA interactions for Protein: O55203

Ldb2, LIM domain-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb2O55203 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ldb2O55203 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ldb2O55203 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ldb2O55203 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ldb2O55203 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ldb2O55203 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ldb2O55203 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ldb2O55203 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ldb2O55203 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ldb2O55203 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ldb2O55203 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ldb2O55203 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ldb2O55203 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ldb2O55203 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ldb2O55203 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ldb2O55203 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ldb2O55203 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ldb2O55203 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ldb2O55203 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ldb2O55203 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ldb2O55203 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ldb2O55203 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ldb2O55203 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ldb2O55203 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ldb2O55203 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ldb2O55203 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ldb2O55203 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ldb2O55203 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ldb2O55203 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ldb2O55203 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ldb2O55203 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ldb2O55203 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ldb2O55203 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ldb2O55203 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ldb2O55203 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ldb2O55203 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ldb2O55203 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ldb2O55203 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ldb2O55203 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ldb2O55203 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ldb2O55203 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ldb2O55203 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ldb2O55203 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ldb2O55203 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ldb2O55203 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ldb2O55203 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ldb2O55203 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ldb2O55203 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ldb2O55203 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ldb2O55203 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ldb2O55203 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ldb2O55203 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ldb2O55203 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ldb2O55203 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ldb2O55203 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ldb2O55203 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ldb2O55203 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ldb2O55203 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ldb2O55203 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ldb2O55203 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ldb2O55203 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ldb2O55203 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ldb2O55203 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ldb2O55203 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ldb2O55203 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ldb2O55203 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ldb2O55203 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ldb2O55203 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ldb2O55203 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ldb2O55203 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ldb2O55203 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ldb2O55203 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ldb2O55203 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ldb2O55203 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ldb2O55203 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ldb2O55203 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ldb2O55203 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ldb2O55203 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ldb2O55203 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ldb2O55203 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ldb2O55203 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ldb2O55203 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ldb2O55203 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ldb2O55203 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ldb2O55203 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ldb2O55203 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ldb2O55203 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ldb2O55203 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ldb2O55203 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ldb2O55203 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ldb2O55203 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ldb2O55203 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ldb2O55203 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ldb2O55203 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ldb2O55203 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ldb2O55203 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ldb2O55203 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ldb2O55203 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ldb2O55203 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ldb2O55203 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms