Protein–RNA interactions for Protein: O55176

Pja1, E3 ubiquitin-protein ligase Praja-1, mousemouse

Predictions only

Length 578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pja1O55176 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pja1O55176 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pja1O55176 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pja1O55176 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pja1O55176 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pja1O55176 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pja1O55176 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pja1O55176 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pja1O55176 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pja1O55176 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pja1O55176 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pja1O55176 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pja1O55176 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pja1O55176 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pja1O55176 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pja1O55176 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pja1O55176 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pja1O55176 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pja1O55176 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pja1O55176 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pja1O55176 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pja1O55176 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pja1O55176 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pja1O55176 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pja1O55176 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Pja1O55176 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pja1O55176 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Pja1O55176 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Pja1O55176 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pja1O55176 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pja1O55176 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pja1O55176 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pja1O55176 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pja1O55176 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pja1O55176 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pja1O55176 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pja1O55176 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pja1O55176 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pja1O55176 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pja1O55176 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pja1O55176 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pja1O55176 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pja1O55176 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pja1O55176 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pja1O55176 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pja1O55176 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pja1O55176 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Pja1O55176 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Pja1O55176 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pja1O55176 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pja1O55176 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pja1O55176 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pja1O55176 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Pja1O55176 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pja1O55176 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pja1O55176 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pja1O55176 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pja1O55176 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pja1O55176 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pja1O55176 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pja1O55176 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pja1O55176 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pja1O55176 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pja1O55176 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pja1O55176 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pja1O55176 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pja1O55176 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pja1O55176 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pja1O55176 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pja1O55176 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Pja1O55176 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pja1O55176 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pja1O55176 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pja1O55176 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pja1O55176 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pja1O55176 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pja1O55176 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pja1O55176 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pja1O55176 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pja1O55176 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pja1O55176 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pja1O55176 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pja1O55176 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pja1O55176 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pja1O55176 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pja1O55176 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pja1O55176 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pja1O55176 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pja1O55176 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pja1O55176 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pja1O55176 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pja1O55176 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Pja1O55176 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pja1O55176 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pja1O55176 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pja1O55176 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pja1O55176 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pja1O55176 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pja1O55176 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pja1O55176 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms