Protein–RNA interactions for Protein: O55142

Rpl35a, 60S ribosomal protein L35a, mousemouse

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Length 110 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl35aO55142 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rpl35aO55142 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rpl35aO55142 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rpl35aO55142 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rpl35aO55142 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rpl35aO55142 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rpl35aO55142 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rpl35aO55142 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rpl35aO55142 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rpl35aO55142 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rpl35aO55142 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rpl35aO55142 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rpl35aO55142 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rpl35aO55142 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rpl35aO55142 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rpl35aO55142 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rpl35aO55142 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rpl35aO55142 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rpl35aO55142 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rpl35aO55142 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rpl35aO55142 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rpl35aO55142 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rpl35aO55142 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rpl35aO55142 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rpl35aO55142 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rpl35aO55142 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Rpl35aO55142 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rpl35aO55142 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rpl35aO55142 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rpl35aO55142 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rpl35aO55142 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rpl35aO55142 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rpl35aO55142 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rpl35aO55142 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rpl35aO55142 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rpl35aO55142 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rpl35aO55142 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rpl35aO55142 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rpl35aO55142 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rpl35aO55142 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rpl35aO55142 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rpl35aO55142 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rpl35aO55142 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rpl35aO55142 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rpl35aO55142 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rpl35aO55142 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rpl35aO55142 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rpl35aO55142 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rpl35aO55142 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Rpl35aO55142 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Rpl35aO55142 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Rpl35aO55142 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rpl35aO55142 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rpl35aO55142 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Rpl35aO55142 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Rpl35aO55142 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Rpl35aO55142 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Rpl35aO55142 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Rpl35aO55142 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rpl35aO55142 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rpl35aO55142 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rpl35aO55142 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rpl35aO55142 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rpl35aO55142 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rpl35aO55142 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rpl35aO55142 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rpl35aO55142 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rpl35aO55142 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rpl35aO55142 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rpl35aO55142 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rpl35aO55142 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rpl35aO55142 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Rpl35aO55142 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Rpl35aO55142 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rpl35aO55142 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Rpl35aO55142 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Rpl35aO55142 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Rpl35aO55142 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rpl35aO55142 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rpl35aO55142 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rpl35aO55142 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rpl35aO55142 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rpl35aO55142 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rpl35aO55142 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rpl35aO55142 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
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