Protein–RNA interactions for Protein: O55111

Dsg2, Desmoglein-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg2O55111 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Dsg2O55111 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Dsg2O55111 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dsg2O55111 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dsg2O55111 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dsg2O55111 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dsg2O55111 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dsg2O55111 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dsg2O55111 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dsg2O55111 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dsg2O55111 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dsg2O55111 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Dsg2O55111 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dsg2O55111 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dsg2O55111 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dsg2O55111 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dsg2O55111 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dsg2O55111 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dsg2O55111 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dsg2O55111 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dsg2O55111 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dsg2O55111 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dsg2O55111 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dsg2O55111 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dsg2O55111 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Dsg2O55111 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dsg2O55111 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dsg2O55111 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dsg2O55111 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dsg2O55111 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dsg2O55111 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dsg2O55111 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dsg2O55111 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dsg2O55111 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dsg2O55111 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dsg2O55111 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dsg2O55111 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dsg2O55111 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dsg2O55111 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dsg2O55111 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dsg2O55111 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Dsg2O55111 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dsg2O55111 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dsg2O55111 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dsg2O55111 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Dsg2O55111 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Dsg2O55111 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Dsg2O55111 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Dsg2O55111 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Dsg2O55111 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Dsg2O55111 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Dsg2O55111 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Dsg2O55111 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Dsg2O55111 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Dsg2O55111 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Dsg2O55111 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Dsg2O55111 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Dsg2O55111 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Dsg2O55111 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Dsg2O55111 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Dsg2O55111 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Dsg2O55111 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Dsg2O55111 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Dsg2O55111 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Dsg2O55111 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Dsg2O55111 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Dsg2O55111 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Dsg2O55111 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Dsg2O55111 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Dsg2O55111 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Dsg2O55111 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Dsg2O55111 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Dsg2O55111 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Dsg2O55111 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Dsg2O55111 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Dsg2O55111 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Dsg2O55111 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dsg2O55111 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dsg2O55111 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dsg2O55111 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dsg2O55111 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dsg2O55111 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dsg2O55111 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dsg2O55111 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dsg2O55111 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dsg2O55111 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dsg2O55111 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dsg2O55111 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dsg2O55111 Cdk5rap1-202ENSMUST00000109730 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dsg2O55111 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dsg2O55111 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dsg2O55111 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dsg2O55111 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Dsg2O55111 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dsg2O55111 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dsg2O55111 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dsg2O55111 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dsg2O55111 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dsg2O55111 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dsg2O55111 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms