Protein–RNA interactions for Protein: O54988

Slk, STE20-like serine/threonine-protein kinase, mousemouse

Predictions only

Length 1,233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SlkO54988 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SlkO54988 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SlkO54988 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SlkO54988 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SlkO54988 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SlkO54988 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SlkO54988 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SlkO54988 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SlkO54988 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SlkO54988 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SlkO54988 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SlkO54988 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SlkO54988 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SlkO54988 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SlkO54988 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SlkO54988 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SlkO54988 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SlkO54988 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SlkO54988 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SlkO54988 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SlkO54988 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SlkO54988 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SlkO54988 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SlkO54988 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SlkO54988 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SlkO54988 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SlkO54988 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SlkO54988 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SlkO54988 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SlkO54988 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SlkO54988 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SlkO54988 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SlkO54988 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SlkO54988 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SlkO54988 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SlkO54988 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SlkO54988 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SlkO54988 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SlkO54988 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SlkO54988 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SlkO54988 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SlkO54988 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SlkO54988 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SlkO54988 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SlkO54988 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SlkO54988 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SlkO54988 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SlkO54988 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SlkO54988 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SlkO54988 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SlkO54988 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SlkO54988 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SlkO54988 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SlkO54988 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SlkO54988 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SlkO54988 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SlkO54988 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SlkO54988 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SlkO54988 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SlkO54988 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SlkO54988 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SlkO54988 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SlkO54988 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SlkO54988 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SlkO54988 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SlkO54988 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SlkO54988 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SlkO54988 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SlkO54988 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SlkO54988 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SlkO54988 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SlkO54988 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SlkO54988 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SlkO54988 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SlkO54988 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SlkO54988 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SlkO54988 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SlkO54988 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SlkO54988 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SlkO54988 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SlkO54988 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SlkO54988 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SlkO54988 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SlkO54988 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SlkO54988 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SlkO54988 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SlkO54988 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SlkO54988 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SlkO54988 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SlkO54988 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SlkO54988 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SlkO54988 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SlkO54988 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SlkO54988 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SlkO54988 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SlkO54988 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
SlkO54988 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SlkO54988 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SlkO54988 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SlkO54988 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms