Protein–RNA interactions for Protein: O54804

Chka, Choline kinase alpha, mousemouse

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Length 453 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChkaO54804 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ChkaO54804 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ChkaO54804 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ChkaO54804 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ChkaO54804 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ChkaO54804 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ChkaO54804 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ChkaO54804 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ChkaO54804 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ChkaO54804 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ChkaO54804 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ChkaO54804 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ChkaO54804 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ChkaO54804 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ChkaO54804 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ChkaO54804 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ChkaO54804 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ChkaO54804 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ChkaO54804 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ChkaO54804 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ChkaO54804 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ChkaO54804 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ChkaO54804 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ChkaO54804 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ChkaO54804 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ChkaO54804 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ChkaO54804 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ChkaO54804 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ChkaO54804 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ChkaO54804 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ChkaO54804 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ChkaO54804 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ChkaO54804 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ChkaO54804 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ChkaO54804 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ChkaO54804 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ChkaO54804 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ChkaO54804 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ChkaO54804 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ChkaO54804 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ChkaO54804 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ChkaO54804 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ChkaO54804 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ChkaO54804 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ChkaO54804 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ChkaO54804 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ChkaO54804 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ChkaO54804 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ChkaO54804 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ChkaO54804 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ChkaO54804 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ChkaO54804 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ChkaO54804 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
ChkaO54804 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ChkaO54804 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ChkaO54804 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ChkaO54804 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
ChkaO54804 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ChkaO54804 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ChkaO54804 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ChkaO54804 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ChkaO54804 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ChkaO54804 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ChkaO54804 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ChkaO54804 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ChkaO54804 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ChkaO54804 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ChkaO54804 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
ChkaO54804 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ChkaO54804 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ChkaO54804 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ChkaO54804 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ChkaO54804 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ChkaO54804 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ChkaO54804 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ChkaO54804 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ChkaO54804 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ChkaO54804 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
ChkaO54804 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
ChkaO54804 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ChkaO54804 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ChkaO54804 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ChkaO54804 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ChkaO54804 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ChkaO54804 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ChkaO54804 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ChkaO54804 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ChkaO54804 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ChkaO54804 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ChkaO54804 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ChkaO54804 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ChkaO54804 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ChkaO54804 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ChkaO54804 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ChkaO54804 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ChkaO54804 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ChkaO54804 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ChkaO54804 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ChkaO54804 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ChkaO54804 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.3 ms