Protein–RNA interactions for Protein: O54751

Crx, Cone-rod homeobox protein, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrxO54751 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
CrxO54751 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
CrxO54751 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
CrxO54751 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
CrxO54751 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
CrxO54751 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
CrxO54751 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
CrxO54751 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
CrxO54751 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
CrxO54751 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
CrxO54751 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
CrxO54751 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
CrxO54751 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
CrxO54751 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
CrxO54751 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
CrxO54751 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
CrxO54751 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
CrxO54751 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
CrxO54751 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
CrxO54751 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
CrxO54751 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
CrxO54751 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
CrxO54751 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
CrxO54751 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
CrxO54751 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
CrxO54751 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
CrxO54751 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
CrxO54751 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
CrxO54751 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
CrxO54751 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
CrxO54751 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
CrxO54751 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
CrxO54751 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
CrxO54751 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
CrxO54751 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
CrxO54751 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
CrxO54751 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
CrxO54751 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
CrxO54751 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
CrxO54751 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
CrxO54751 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
CrxO54751 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
CrxO54751 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
CrxO54751 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
CrxO54751 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
CrxO54751 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
CrxO54751 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
CrxO54751 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
CrxO54751 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
CrxO54751 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
CrxO54751 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
CrxO54751 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
CrxO54751 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
CrxO54751 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
CrxO54751 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
CrxO54751 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
CrxO54751 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
CrxO54751 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
CrxO54751 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
CrxO54751 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
CrxO54751 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
CrxO54751 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
CrxO54751 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
CrxO54751 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
CrxO54751 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC11.47□□□□□ -0.57
CrxO54751 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
CrxO54751 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
CrxO54751 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
CrxO54751 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
CrxO54751 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
CrxO54751 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
CrxO54751 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
CrxO54751 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
CrxO54751 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
CrxO54751 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
CrxO54751 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
CrxO54751 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
CrxO54751 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
CrxO54751 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
CrxO54751 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
CrxO54751 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
CrxO54751 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
CrxO54751 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
CrxO54751 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
CrxO54751 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
CrxO54751 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
CrxO54751 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
CrxO54751 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
CrxO54751 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
CrxO54751 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
CrxO54751 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
CrxO54751 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
CrxO54751 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
CrxO54751 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
CrxO54751 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
CrxO54751 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
CrxO54751 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
CrxO54751 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
CrxO54751 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
CrxO54751 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms