Protein–RNA interactions for Protein: O35892

Sp100, Nuclear autoantigen Sp-100, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp100O35892 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sp100O35892 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sp100O35892 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sp100O35892 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sp100O35892 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sp100O35892 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sp100O35892 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sp100O35892 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sp100O35892 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sp100O35892 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sp100O35892 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sp100O35892 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sp100O35892 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sp100O35892 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sp100O35892 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sp100O35892 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sp100O35892 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sp100O35892 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sp100O35892 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sp100O35892 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sp100O35892 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sp100O35892 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sp100O35892 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sp100O35892 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Sp100O35892 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sp100O35892 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sp100O35892 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Sp100O35892 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Sp100O35892 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sp100O35892 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sp100O35892 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sp100O35892 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sp100O35892 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sp100O35892 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sp100O35892 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sp100O35892 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sp100O35892 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sp100O35892 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sp100O35892 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sp100O35892 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sp100O35892 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sp100O35892 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sp100O35892 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sp100O35892 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sp100O35892 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sp100O35892 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sp100O35892 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sp100O35892 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sp100O35892 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sp100O35892 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sp100O35892 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sp100O35892 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sp100O35892 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sp100O35892 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sp100O35892 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Sp100O35892 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sp100O35892 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sp100O35892 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sp100O35892 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sp100O35892 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sp100O35892 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sp100O35892 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sp100O35892 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Sp100O35892 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sp100O35892 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Sp100O35892 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Sp100O35892 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Sp100O35892 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sp100O35892 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sp100O35892 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sp100O35892 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sp100O35892 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sp100O35892 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Sp100O35892 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sp100O35892 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sp100O35892 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sp100O35892 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sp100O35892 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sp100O35892 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sp100O35892 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sp100O35892 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sp100O35892 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sp100O35892 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sp100O35892 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sp100O35892 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sp100O35892 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sp100O35892 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sp100O35892 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sp100O35892 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sp100O35892 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sp100O35892 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sp100O35892 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sp100O35892 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sp100O35892 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sp100O35892 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sp100O35892 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sp100O35892 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sp100O35892 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sp100O35892 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sp100O35892 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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