Protein–RNA interactions for Protein: O35714

Tnfrsf18, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 18, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf18O35714 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tnfrsf18O35714 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tnfrsf18O35714 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tnfrsf18O35714 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Tnfrsf18O35714 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Tnfrsf18O35714 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tnfrsf18O35714 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tnfrsf18O35714 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tnfrsf18O35714 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tnfrsf18O35714 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tnfrsf18O35714 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tnfrsf18O35714 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tnfrsf18O35714 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tnfrsf18O35714 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tnfrsf18O35714 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tnfrsf18O35714 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tnfrsf18O35714 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tnfrsf18O35714 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tnfrsf18O35714 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tnfrsf18O35714 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tnfrsf18O35714 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tnfrsf18O35714 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tnfrsf18O35714 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tnfrsf18O35714 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tnfrsf18O35714 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tnfrsf18O35714 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tnfrsf18O35714 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tnfrsf18O35714 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tnfrsf18O35714 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tnfrsf18O35714 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tnfrsf18O35714 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tnfrsf18O35714 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Tnfrsf18O35714 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Tnfrsf18O35714 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tnfrsf18O35714 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tnfrsf18O35714 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tnfrsf18O35714 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tnfrsf18O35714 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tnfrsf18O35714 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tnfrsf18O35714 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tnfrsf18O35714 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tnfrsf18O35714 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnfrsf18O35714 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnfrsf18O35714 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnfrsf18O35714 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnfrsf18O35714 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnfrsf18O35714 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnfrsf18O35714 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnfrsf18O35714 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnfrsf18O35714 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnfrsf18O35714 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
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Tnfrsf18O35714 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnfrsf18O35714 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnfrsf18O35714 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnfrsf18O35714 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnfrsf18O35714 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnfrsf18O35714 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnfrsf18O35714 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnfrsf18O35714 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnfrsf18O35714 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnfrsf18O35714 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnfrsf18O35714 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnfrsf18O35714 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnfrsf18O35714 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnfrsf18O35714 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnfrsf18O35714 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnfrsf18O35714 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnfrsf18O35714 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnfrsf18O35714 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tnfrsf18O35714 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tnfrsf18O35714 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tnfrsf18O35714 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tnfrsf18O35714 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tnfrsf18O35714 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tnfrsf18O35714 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tnfrsf18O35714 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tnfrsf18O35714 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Tnfrsf18O35714 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tnfrsf18O35714 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tnfrsf18O35714 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tnfrsf18O35714 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tnfrsf18O35714 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Tnfrsf18O35714 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tnfrsf18O35714 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tnfrsf18O35714 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tnfrsf18O35714 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tnfrsf18O35714 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tnfrsf18O35714 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tnfrsf18O35714 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tnfrsf18O35714 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tnfrsf18O35714 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tnfrsf18O35714 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tnfrsf18O35714 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tnfrsf18O35714 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tnfrsf18O35714 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tnfrsf18O35714 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tnfrsf18O35714 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tnfrsf18O35714 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms