Protein–RNA interactions for Protein: O35654

Pold2, DNA polymerase delta subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pold2O35654 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pold2O35654 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Pold2O35654 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pold2O35654 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pold2O35654 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pold2O35654 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pold2O35654 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pold2O35654 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pold2O35654 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pold2O35654 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pold2O35654 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pold2O35654 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pold2O35654 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pold2O35654 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pold2O35654 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pold2O35654 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pold2O35654 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pold2O35654 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pold2O35654 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pold2O35654 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Pold2O35654 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pold2O35654 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pold2O35654 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pold2O35654 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pold2O35654 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pold2O35654 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pold2O35654 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pold2O35654 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pold2O35654 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pold2O35654 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pold2O35654 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pold2O35654 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pold2O35654 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pold2O35654 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pold2O35654 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pold2O35654 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pold2O35654 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pold2O35654 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pold2O35654 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pold2O35654 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pold2O35654 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pold2O35654 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pold2O35654 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pold2O35654 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pold2O35654 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Pold2O35654 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pold2O35654 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pold2O35654 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pold2O35654 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pold2O35654 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pold2O35654 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pold2O35654 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pold2O35654 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pold2O35654 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Pold2O35654 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pold2O35654 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pold2O35654 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pold2O35654 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pold2O35654 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pold2O35654 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pold2O35654 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pold2O35654 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pold2O35654 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pold2O35654 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pold2O35654 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pold2O35654 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pold2O35654 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pold2O35654 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pold2O35654 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pold2O35654 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pold2O35654 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pold2O35654 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pold2O35654 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pold2O35654 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pold2O35654 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pold2O35654 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pold2O35654 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pold2O35654 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pold2O35654 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pold2O35654 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pold2O35654 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Pold2O35654 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pold2O35654 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pold2O35654 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pold2O35654 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pold2O35654 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pold2O35654 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pold2O35654 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pold2O35654 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pold2O35654 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pold2O35654 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pold2O35654 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pold2O35654 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pold2O35654 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pold2O35654 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pold2O35654 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pold2O35654 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pold2O35654 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pold2O35654 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pold2O35654 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms