Protein–RNA interactions for Protein: O35493

Clk4, Dual specificity protein kinase CLK4, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clk4O35493 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Clk4O35493 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Clk4O35493 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Clk4O35493 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Clk4O35493 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Clk4O35493 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Clk4O35493 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Clk4O35493 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Clk4O35493 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Clk4O35493 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Clk4O35493 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Clk4O35493 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Clk4O35493 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Clk4O35493 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Clk4O35493 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Clk4O35493 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Clk4O35493 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Clk4O35493 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Clk4O35493 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Clk4O35493 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Clk4O35493 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Clk4O35493 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
Clk4O35493 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Clk4O35493 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Clk4O35493 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Clk4O35493 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Clk4O35493 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Clk4O35493 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Clk4O35493 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Clk4O35493 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Clk4O35493 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Clk4O35493 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Clk4O35493 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Clk4O35493 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Clk4O35493 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Clk4O35493 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Clk4O35493 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Clk4O35493 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Clk4O35493 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Clk4O35493 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Clk4O35493 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Clk4O35493 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Clk4O35493 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Clk4O35493 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Clk4O35493 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Clk4O35493 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Clk4O35493 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Clk4O35493 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Clk4O35493 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Clk4O35493 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Clk4O35493 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Clk4O35493 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Clk4O35493 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Clk4O35493 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Clk4O35493 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Clk4O35493 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Clk4O35493 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Clk4O35493 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Clk4O35493 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Clk4O35493 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Clk4O35493 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Clk4O35493 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Clk4O35493 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Clk4O35493 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Clk4O35493 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Clk4O35493 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Clk4O35493 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Clk4O35493 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Clk4O35493 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Clk4O35493 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Clk4O35493 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Clk4O35493 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Clk4O35493 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Clk4O35493 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Clk4O35493 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Clk4O35493 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Clk4O35493 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.04■□□□□ -0
Clk4O35493 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Clk4O35493 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Clk4O35493 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Clk4O35493 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Clk4O35493 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Clk4O35493 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Clk4O35493 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Clk4O35493 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Clk4O35493 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Clk4O35493 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Clk4O35493 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Clk4O35493 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Clk4O35493 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Clk4O35493 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Clk4O35493 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Clk4O35493 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Clk4O35493 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Clk4O35493 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Clk4O35493 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Clk4O35493 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Clk4O35493 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Clk4O35493 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Clk4O35493 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms