Protein–RNA interactions for Protein: O35492

Clk3, Dual specificity protein kinase CLK3, mousemouse

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Length 638 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clk3O35492 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Clk3O35492 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Clk3O35492 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Clk3O35492 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Clk3O35492 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Clk3O35492 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Clk3O35492 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Clk3O35492 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Clk3O35492 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Clk3O35492 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Clk3O35492 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Clk3O35492 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Clk3O35492 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Clk3O35492 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Clk3O35492 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Clk3O35492 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Clk3O35492 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Clk3O35492 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Clk3O35492 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Clk3O35492 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Clk3O35492 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Clk3O35492 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Clk3O35492 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Clk3O35492 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Clk3O35492 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Clk3O35492 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Clk3O35492 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Clk3O35492 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Clk3O35492 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Clk3O35492 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Clk3O35492 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Clk3O35492 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Clk3O35492 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Clk3O35492 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Clk3O35492 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Clk3O35492 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Clk3O35492 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Clk3O35492 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Clk3O35492 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Clk3O35492 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Clk3O35492 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Clk3O35492 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Clk3O35492 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Clk3O35492 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Clk3O35492 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Clk3O35492 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Clk3O35492 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Clk3O35492 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Clk3O35492 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Clk3O35492 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Clk3O35492 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Clk3O35492 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Clk3O35492 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Clk3O35492 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Clk3O35492 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Clk3O35492 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Clk3O35492 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Clk3O35492 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Clk3O35492 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Clk3O35492 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Clk3O35492 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Clk3O35492 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Clk3O35492 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Clk3O35492 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Clk3O35492 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Clk3O35492 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Clk3O35492 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Clk3O35492 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Clk3O35492 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Clk3O35492 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Clk3O35492 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Clk3O35492 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Clk3O35492 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Clk3O35492 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Clk3O35492 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Clk3O35492 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Clk3O35492 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Clk3O35492 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Clk3O35492 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Clk3O35492 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Clk3O35492 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Clk3O35492 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Clk3O35492 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Clk3O35492 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Clk3O35492 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Clk3O35492 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Clk3O35492 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Clk3O35492 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Clk3O35492 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Clk3O35492 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Clk3O35492 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Clk3O35492 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Clk3O35492 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Clk3O35492 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Clk3O35492 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Clk3O35492 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Clk3O35492 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Clk3O35492 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Clk3O35492 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Clk3O35492 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
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