Protein–RNA interactions for Protein: O35488

Slc27a2, Very long-chain acyl-CoA synthetase, mousemouse

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc27a2O35488 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slc27a2O35488 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slc27a2O35488 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slc27a2O35488 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slc27a2O35488 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slc27a2O35488 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slc27a2O35488 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slc27a2O35488 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slc27a2O35488 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slc27a2O35488 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slc27a2O35488 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slc27a2O35488 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Slc27a2O35488 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slc27a2O35488 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slc27a2O35488 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slc27a2O35488 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slc27a2O35488 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slc27a2O35488 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slc27a2O35488 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slc27a2O35488 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slc27a2O35488 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slc27a2O35488 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slc27a2O35488 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slc27a2O35488 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slc27a2O35488 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slc27a2O35488 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slc27a2O35488 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Slc27a2O35488 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Slc27a2O35488 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slc27a2O35488 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slc27a2O35488 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slc27a2O35488 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slc27a2O35488 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slc27a2O35488 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slc27a2O35488 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slc27a2O35488 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slc27a2O35488 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slc27a2O35488 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slc27a2O35488 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Slc27a2O35488 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
Slc27a2O35488 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Slc27a2O35488 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Slc27a2O35488 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Slc27a2O35488 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Slc27a2O35488 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Slc27a2O35488 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Slc27a2O35488 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Slc27a2O35488 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Slc27a2O35488 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Slc27a2O35488 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Slc27a2O35488 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Slc27a2O35488 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Slc27a2O35488 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Slc27a2O35488 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Slc27a2O35488 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Slc27a2O35488 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Slc27a2O35488 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Slc27a2O35488 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Slc27a2O35488 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Slc27a2O35488 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Slc27a2O35488 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Slc27a2O35488 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Slc27a2O35488 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Slc27a2O35488 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Slc27a2O35488 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Slc27a2O35488 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Slc27a2O35488 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Slc27a2O35488 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Slc27a2O35488 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Slc27a2O35488 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Slc27a2O35488 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Slc27a2O35488 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Slc27a2O35488 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Slc27a2O35488 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Slc27a2O35488 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Slc27a2O35488 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Slc27a2O35488 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Slc27a2O35488 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Slc27a2O35488 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Slc27a2O35488 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Slc27a2O35488 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Slc27a2O35488 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Slc27a2O35488 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Slc27a2O35488 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Slc27a2O35488 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Slc27a2O35488 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Slc27a2O35488 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Slc27a2O35488 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Slc27a2O35488 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Slc27a2O35488 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Slc27a2O35488 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Slc27a2O35488 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Slc27a2O35488 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Slc27a2O35488 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Slc27a2O35488 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Slc27a2O35488 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Slc27a2O35488 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Slc27a2O35488 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Slc27a2O35488 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Slc27a2O35488 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms