Protein–RNA interactions for Protein: O35473

C1d, Nuclear nucleic acid-binding protein C1D, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1dO35473 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
C1dO35473 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
C1dO35473 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
C1dO35473 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
C1dO35473 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
C1dO35473 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
C1dO35473 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
C1dO35473 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
C1dO35473 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
C1dO35473 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
C1dO35473 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
C1dO35473 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
C1dO35473 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
C1dO35473 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
C1dO35473 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
C1dO35473 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
C1dO35473 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
C1dO35473 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
C1dO35473 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
C1dO35473 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
C1dO35473 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
C1dO35473 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
C1dO35473 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
C1dO35473 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
C1dO35473 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
C1dO35473 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
C1dO35473 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
C1dO35473 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
C1dO35473 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
C1dO35473 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
C1dO35473 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
C1dO35473 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
C1dO35473 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
C1dO35473 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
C1dO35473 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
C1dO35473 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
C1dO35473 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
C1dO35473 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
C1dO35473 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
C1dO35473 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
C1dO35473 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
C1dO35473 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
C1dO35473 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
C1dO35473 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
C1dO35473 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
C1dO35473 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
C1dO35473 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
C1dO35473 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
C1dO35473 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
C1dO35473 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
C1dO35473 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
C1dO35473 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
C1dO35473 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
C1dO35473 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
C1dO35473 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
C1dO35473 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
C1dO35473 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
C1dO35473 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
C1dO35473 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
C1dO35473 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
C1dO35473 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
C1dO35473 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
C1dO35473 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
C1dO35473 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
C1dO35473 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
C1dO35473 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
C1dO35473 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
C1dO35473 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
C1dO35473 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
C1dO35473 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
C1dO35473 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
C1dO35473 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
C1dO35473 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
C1dO35473 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
C1dO35473 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
C1dO35473 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
C1dO35473 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
C1dO35473 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
C1dO35473 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
C1dO35473 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
C1dO35473 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
C1dO35473 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
C1dO35473 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
C1dO35473 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
C1dO35473 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
C1dO35473 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
C1dO35473 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
C1dO35473 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
C1dO35473 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
C1dO35473 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
C1dO35473 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
C1dO35473 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
C1dO35473 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
C1dO35473 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
C1dO35473 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
C1dO35473 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
C1dO35473 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
C1dO35473 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
C1dO35473 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
C1dO35473 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.5 ms