Protein–RNA interactions for Protein: O35464

Sema6a, Semaphorin-6A, mousemouse

Predictions only

Length 1,031 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema6aO35464 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sema6aO35464 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Sema6aO35464 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Sema6aO35464 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sema6aO35464 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Sema6aO35464 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Sema6aO35464 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sema6aO35464 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sema6aO35464 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sema6aO35464 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sema6aO35464 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sema6aO35464 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Sema6aO35464 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sema6aO35464 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sema6aO35464 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sema6aO35464 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sema6aO35464 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sema6aO35464 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sema6aO35464 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sema6aO35464 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sema6aO35464 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Sema6aO35464 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Sema6aO35464 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sema6aO35464 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sema6aO35464 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sema6aO35464 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Sema6aO35464 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Sema6aO35464 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Sema6aO35464 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Sema6aO35464 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Sema6aO35464 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sema6aO35464 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sema6aO35464 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sema6aO35464 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sema6aO35464 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sema6aO35464 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sema6aO35464 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Sema6aO35464 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sema6aO35464 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sema6aO35464 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sema6aO35464 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sema6aO35464 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Sema6aO35464 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Sema6aO35464 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sema6aO35464 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sema6aO35464 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sema6aO35464 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sema6aO35464 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Sema6aO35464 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Sema6aO35464 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sema6aO35464 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Sema6aO35464 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Sema6aO35464 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sema6aO35464 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sema6aO35464 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.06■□□□□ 0
Sema6aO35464 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Sema6aO35464 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sema6aO35464 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Sema6aO35464 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Sema6aO35464 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Sema6aO35464 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Sema6aO35464 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sema6aO35464 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sema6aO35464 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sema6aO35464 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sema6aO35464 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sema6aO35464 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Sema6aO35464 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sema6aO35464 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sema6aO35464 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Sema6aO35464 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Sema6aO35464 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Sema6aO35464 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sema6aO35464 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sema6aO35464 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sema6aO35464 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Sema6aO35464 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sema6aO35464 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Sema6aO35464 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Sema6aO35464 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Sema6aO35464 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Sema6aO35464 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Sema6aO35464 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Sema6aO35464 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Sema6aO35464 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Sema6aO35464 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sema6aO35464 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sema6aO35464 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Sema6aO35464 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Sema6aO35464 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Sema6aO35464 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sema6aO35464 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sema6aO35464 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sema6aO35464 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sema6aO35464 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sema6aO35464 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sema6aO35464 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Sema6aO35464 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Sema6aO35464 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Sema6aO35464 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms