Protein–RNA interactions for Protein: O35449

Prrt1, Proline-rich transmembrane protein 1, mousemouse

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Length 306 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt1O35449 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Prrt1O35449 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Prrt1O35449 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Prrt1O35449 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Prrt1O35449 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Prrt1O35449 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Prrt1O35449 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Prrt1O35449 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Prrt1O35449 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Prrt1O35449 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Prrt1O35449 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Prrt1O35449 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Prrt1O35449 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Prrt1O35449 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Prrt1O35449 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Prrt1O35449 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Prrt1O35449 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Prrt1O35449 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Prrt1O35449 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Prrt1O35449 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Prrt1O35449 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Prrt1O35449 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Prrt1O35449 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Prrt1O35449 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Prrt1O35449 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Prrt1O35449 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Prrt1O35449 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Prrt1O35449 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Prrt1O35449 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Prrt1O35449 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Prrt1O35449 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Prrt1O35449 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Prrt1O35449 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Prrt1O35449 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Prrt1O35449 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Prrt1O35449 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Prrt1O35449 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Prrt1O35449 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Prrt1O35449 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Prrt1O35449 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Prrt1O35449 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Prrt1O35449 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Prrt1O35449 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Prrt1O35449 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Prrt1O35449 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Prrt1O35449 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Prrt1O35449 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Prrt1O35449 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Prrt1O35449 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Prrt1O35449 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Prrt1O35449 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Prrt1O35449 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Prrt1O35449 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Prrt1O35449 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
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Prrt1O35449 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Prrt1O35449 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Prrt1O35449 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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Prrt1O35449 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Prrt1O35449 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Prrt1O35449 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Prrt1O35449 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Prrt1O35449 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Prrt1O35449 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Prrt1O35449 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Prrt1O35449 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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Prrt1O35449 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Prrt1O35449 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Prrt1O35449 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Prrt1O35449 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Prrt1O35449 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Prrt1O35449 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Prrt1O35449 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Prrt1O35449 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Prrt1O35449 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Prrt1O35449 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Prrt1O35449 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Prrt1O35449 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Prrt1O35449 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Prrt1O35449 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Prrt1O35449 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Prrt1O35449 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Prrt1O35449 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Prrt1O35449 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Prrt1O35449 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Prrt1O35449 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Prrt1O35449 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Prrt1O35449 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Prrt1O35449 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Prrt1O35449 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Prrt1O35449 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Prrt1O35449 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Prrt1O35449 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Prrt1O35449 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Prrt1O35449 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Prrt1O35449 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
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