Protein–RNA interactions for Protein: O35350

Capn1, Calpain-1 catalytic subunit, mousemouse

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Length 713 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn1O35350 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Capn1O35350 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Capn1O35350 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Capn1O35350 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Capn1O35350 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Capn1O35350 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Capn1O35350 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Capn1O35350 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Capn1O35350 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Capn1O35350 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Capn1O35350 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Capn1O35350 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Capn1O35350 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Capn1O35350 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Capn1O35350 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Capn1O35350 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Capn1O35350 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Capn1O35350 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Capn1O35350 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Capn1O35350 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Capn1O35350 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Capn1O35350 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Capn1O35350 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Capn1O35350 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Capn1O35350 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Capn1O35350 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Capn1O35350 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Capn1O35350 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Capn1O35350 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Capn1O35350 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Capn1O35350 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Capn1O35350 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Capn1O35350 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Capn1O35350 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Capn1O35350 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Capn1O35350 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Capn1O35350 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Capn1O35350 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Capn1O35350 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Capn1O35350 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Capn1O35350 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Capn1O35350 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Capn1O35350 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Capn1O35350 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Capn1O35350 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Capn1O35350 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Capn1O35350 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Capn1O35350 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Capn1O35350 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Capn1O35350 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Capn1O35350 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Capn1O35350 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Capn1O35350 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Capn1O35350 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Capn1O35350 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Capn1O35350 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Capn1O35350 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Capn1O35350 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Capn1O35350 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Capn1O35350 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Capn1O35350 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Capn1O35350 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Capn1O35350 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Capn1O35350 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Capn1O35350 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Capn1O35350 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Capn1O35350 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Capn1O35350 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Capn1O35350 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Capn1O35350 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Capn1O35350 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Capn1O35350 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Capn1O35350 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Capn1O35350 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Capn1O35350 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Capn1O35350 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Capn1O35350 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Capn1O35350 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Capn1O35350 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Capn1O35350 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Capn1O35350 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Capn1O35350 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Capn1O35350 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Capn1O35350 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Capn1O35350 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Capn1O35350 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Capn1O35350 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Capn1O35350 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Capn1O35350 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Capn1O35350 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Capn1O35350 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Capn1O35350 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Capn1O35350 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Capn1O35350 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Capn1O35350 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Capn1O35350 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Capn1O35350 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Capn1O35350 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Capn1O35350 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Capn1O35350 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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