Protein–RNA interactions for Protein: O35344

Kpna3, Importin subunit alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 521 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kpna3O35344 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kpna3O35344 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kpna3O35344 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kpna3O35344 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kpna3O35344 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kpna3O35344 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kpna3O35344 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kpna3O35344 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kpna3O35344 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kpna3O35344 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kpna3O35344 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kpna3O35344 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kpna3O35344 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kpna3O35344 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kpna3O35344 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kpna3O35344 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kpna3O35344 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kpna3O35344 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kpna3O35344 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kpna3O35344 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kpna3O35344 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kpna3O35344 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Kpna3O35344 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kpna3O35344 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Kpna3O35344 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Kpna3O35344 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Kpna3O35344 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Kpna3O35344 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Kpna3O35344 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kpna3O35344 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kpna3O35344 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kpna3O35344 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kpna3O35344 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kpna3O35344 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kpna3O35344 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kpna3O35344 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kpna3O35344 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Kpna3O35344 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kpna3O35344 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kpna3O35344 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kpna3O35344 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kpna3O35344 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kpna3O35344 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kpna3O35344 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kpna3O35344 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kpna3O35344 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kpna3O35344 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kpna3O35344 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kpna3O35344 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kpna3O35344 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kpna3O35344 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kpna3O35344 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kpna3O35344 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kpna3O35344 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kpna3O35344 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kpna3O35344 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kpna3O35344 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kpna3O35344 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kpna3O35344 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Kpna3O35344 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kpna3O35344 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Kpna3O35344 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kpna3O35344 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kpna3O35344 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kpna3O35344 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Kpna3O35344 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Kpna3O35344 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kpna3O35344 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kpna3O35344 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kpna3O35344 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kpna3O35344 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kpna3O35344 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kpna3O35344 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kpna3O35344 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kpna3O35344 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kpna3O35344 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kpna3O35344 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kpna3O35344 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kpna3O35344 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kpna3O35344 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kpna3O35344 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kpna3O35344 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kpna3O35344 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kpna3O35344 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kpna3O35344 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Kpna3O35344 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kpna3O35344 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kpna3O35344 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Kpna3O35344 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kpna3O35344 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Kpna3O35344 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kpna3O35344 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Kpna3O35344 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kpna3O35344 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kpna3O35344 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Kpna3O35344 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Kpna3O35344 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kpna3O35344 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kpna3O35344 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kpna3O35344 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms