Protein–RNA interactions for Protein: O35310

Hs3st1, Heparan sulfate glucosamine 3-O-sulfotransferase 1, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hs3st1O35310 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hs3st1O35310 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hs3st1O35310 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hs3st1O35310 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hs3st1O35310 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hs3st1O35310 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hs3st1O35310 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hs3st1O35310 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hs3st1O35310 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hs3st1O35310 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hs3st1O35310 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hs3st1O35310 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hs3st1O35310 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hs3st1O35310 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hs3st1O35310 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hs3st1O35310 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hs3st1O35310 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hs3st1O35310 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hs3st1O35310 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hs3st1O35310 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hs3st1O35310 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hs3st1O35310 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hs3st1O35310 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hs3st1O35310 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hs3st1O35310 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hs3st1O35310 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Hs3st1O35310 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hs3st1O35310 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hs3st1O35310 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hs3st1O35310 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hs3st1O35310 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hs3st1O35310 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hs3st1O35310 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hs3st1O35310 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hs3st1O35310 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Hs3st1O35310 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hs3st1O35310 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hs3st1O35310 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hs3st1O35310 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hs3st1O35310 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hs3st1O35310 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hs3st1O35310 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hs3st1O35310 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hs3st1O35310 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hs3st1O35310 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hs3st1O35310 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hs3st1O35310 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hs3st1O35310 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hs3st1O35310 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Hs3st1O35310 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hs3st1O35310 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Hs3st1O35310 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hs3st1O35310 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hs3st1O35310 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hs3st1O35310 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hs3st1O35310 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hs3st1O35310 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hs3st1O35310 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hs3st1O35310 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hs3st1O35310 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Hs3st1O35310 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Hs3st1O35310 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Hs3st1O35310 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Hs3st1O35310 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Hs3st1O35310 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Hs3st1O35310 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Hs3st1O35310 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Hs3st1O35310 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hs3st1O35310 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hs3st1O35310 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hs3st1O35310 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hs3st1O35310 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hs3st1O35310 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hs3st1O35310 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hs3st1O35310 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hs3st1O35310 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hs3st1O35310 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Hs3st1O35310 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hs3st1O35310 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hs3st1O35310 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hs3st1O35310 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hs3st1O35310 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hs3st1O35310 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hs3st1O35310 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hs3st1O35310 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hs3st1O35310 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hs3st1O35310 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hs3st1O35310 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hs3st1O35310 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hs3st1O35310 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hs3st1O35310 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hs3st1O35310 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hs3st1O35310 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hs3st1O35310 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hs3st1O35310 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hs3st1O35310 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hs3st1O35310 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hs3st1O35310 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hs3st1O35310 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hs3st1O35310 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms