Protein–RNA interactions for Protein: O35304

Slc18a3, Vesicular acetylcholine transporter, mousemouse

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc18a3O35304 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Slc18a3O35304 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Slc18a3O35304 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Slc18a3O35304 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Slc18a3O35304 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Slc18a3O35304 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Slc18a3O35304 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Slc18a3O35304 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Slc18a3O35304 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Slc18a3O35304 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Slc18a3O35304 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Slc18a3O35304 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Slc18a3O35304 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Slc18a3O35304 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Slc18a3O35304 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Slc18a3O35304 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Slc18a3O35304 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Slc18a3O35304 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Slc18a3O35304 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Slc18a3O35304 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Slc18a3O35304 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Slc18a3O35304 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Slc18a3O35304 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Slc18a3O35304 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Slc18a3O35304 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Slc18a3O35304 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Slc18a3O35304 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Slc18a3O35304 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Slc18a3O35304 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Slc18a3O35304 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Slc18a3O35304 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Slc18a3O35304 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Slc18a3O35304 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Slc18a3O35304 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Slc18a3O35304 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Slc18a3O35304 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Slc18a3O35304 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Slc18a3O35304 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Slc18a3O35304 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Slc18a3O35304 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Slc18a3O35304 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Slc18a3O35304 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Slc18a3O35304 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Slc18a3O35304 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Slc18a3O35304 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Slc18a3O35304 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Slc18a3O35304 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Slc18a3O35304 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Slc18a3O35304 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Slc18a3O35304 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Slc18a3O35304 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Slc18a3O35304 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Slc18a3O35304 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Slc18a3O35304 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Slc18a3O35304 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Slc18a3O35304 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Slc18a3O35304 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Slc18a3O35304 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Slc18a3O35304 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Slc18a3O35304 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Slc18a3O35304 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Slc18a3O35304 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Slc18a3O35304 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Slc18a3O35304 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Slc18a3O35304 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Slc18a3O35304 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Slc18a3O35304 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Slc18a3O35304 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Slc18a3O35304 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Slc18a3O35304 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Slc18a3O35304 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Slc18a3O35304 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Slc18a3O35304 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Slc18a3O35304 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Slc18a3O35304 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Slc18a3O35304 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Slc18a3O35304 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Slc18a3O35304 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Slc18a3O35304 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Slc18a3O35304 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Slc18a3O35304 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Slc18a3O35304 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Slc18a3O35304 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Slc18a3O35304 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Slc18a3O35304 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Slc18a3O35304 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Slc18a3O35304 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Slc18a3O35304 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Slc18a3O35304 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Slc18a3O35304 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Slc18a3O35304 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Slc18a3O35304 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Slc18a3O35304 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Slc18a3O35304 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Slc18a3O35304 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Slc18a3O35304 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Slc18a3O35304 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Slc18a3O35304 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Slc18a3O35304 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Slc18a3O35304 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms