Protein–RNA interactions for Protein: O35216

Cenpa, Histone H3-like centromeric protein A, mousemouse

Predictions only

Length 134 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CenpaO35216 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
CenpaO35216 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
CenpaO35216 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CenpaO35216 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CenpaO35216 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CenpaO35216 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CenpaO35216 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CenpaO35216 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
CenpaO35216 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CenpaO35216 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CenpaO35216 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
CenpaO35216 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CenpaO35216 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CenpaO35216 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CenpaO35216 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CenpaO35216 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CenpaO35216 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CenpaO35216 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CenpaO35216 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CenpaO35216 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
CenpaO35216 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CenpaO35216 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CenpaO35216 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CenpaO35216 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CenpaO35216 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CenpaO35216 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CenpaO35216 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CenpaO35216 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CenpaO35216 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CenpaO35216 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CenpaO35216 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CenpaO35216 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CenpaO35216 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CenpaO35216 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CenpaO35216 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
CenpaO35216 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
CenpaO35216 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CenpaO35216 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CenpaO35216 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CenpaO35216 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CenpaO35216 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CenpaO35216 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CenpaO35216 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CenpaO35216 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CenpaO35216 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CenpaO35216 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CenpaO35216 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CenpaO35216 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CenpaO35216 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CenpaO35216 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CenpaO35216 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CenpaO35216 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CenpaO35216 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CenpaO35216 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CenpaO35216 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CenpaO35216 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CenpaO35216 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CenpaO35216 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CenpaO35216 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CenpaO35216 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CenpaO35216 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CenpaO35216 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CenpaO35216 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
CenpaO35216 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CenpaO35216 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CenpaO35216 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CenpaO35216 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CenpaO35216 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CenpaO35216 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CenpaO35216 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CenpaO35216 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CenpaO35216 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CenpaO35216 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CenpaO35216 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CenpaO35216 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CenpaO35216 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CenpaO35216 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CenpaO35216 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CenpaO35216 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CenpaO35216 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CenpaO35216 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CenpaO35216 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CenpaO35216 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CenpaO35216 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CenpaO35216 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CenpaO35216 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CenpaO35216 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CenpaO35216 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CenpaO35216 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CenpaO35216 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
CenpaO35216 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CenpaO35216 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CenpaO35216 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CenpaO35216 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CenpaO35216 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CenpaO35216 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CenpaO35216 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CenpaO35216 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CenpaO35216 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CenpaO35216 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms