Protein–RNA interactions for Protein: O35185

Bhlhe40, Class E basic helix-loop-helix protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe40O35185 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bhlhe40O35185 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Bhlhe40O35185 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bhlhe40O35185 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bhlhe40O35185 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bhlhe40O35185 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bhlhe40O35185 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bhlhe40O35185 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Bhlhe40O35185 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Bhlhe40O35185 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Bhlhe40O35185 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Bhlhe40O35185 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Bhlhe40O35185 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Bhlhe40O35185 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Bhlhe40O35185 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Bhlhe40O35185 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Bhlhe40O35185 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Bhlhe40O35185 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Bhlhe40O35185 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Bhlhe40O35185 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Bhlhe40O35185 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Bhlhe40O35185 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Bhlhe40O35185 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Bhlhe40O35185 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Bhlhe40O35185 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Bhlhe40O35185 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Bhlhe40O35185 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Bhlhe40O35185 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Bhlhe40O35185 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Bhlhe40O35185 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Bhlhe40O35185 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Bhlhe40O35185 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Bhlhe40O35185 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Bhlhe40O35185 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bhlhe40O35185 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bhlhe40O35185 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bhlhe40O35185 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bhlhe40O35185 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bhlhe40O35185 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bhlhe40O35185 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bhlhe40O35185 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bhlhe40O35185 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bhlhe40O35185 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Bhlhe40O35185 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Bhlhe40O35185 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bhlhe40O35185 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bhlhe40O35185 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bhlhe40O35185 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bhlhe40O35185 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Bhlhe40O35185 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bhlhe40O35185 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bhlhe40O35185 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bhlhe40O35185 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bhlhe40O35185 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bhlhe40O35185 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bhlhe40O35185 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bhlhe40O35185 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bhlhe40O35185 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bhlhe40O35185 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Bhlhe40O35185 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bhlhe40O35185 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bhlhe40O35185 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bhlhe40O35185 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bhlhe40O35185 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bhlhe40O35185 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bhlhe40O35185 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bhlhe40O35185 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bhlhe40O35185 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bhlhe40O35185 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bhlhe40O35185 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bhlhe40O35185 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bhlhe40O35185 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bhlhe40O35185 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bhlhe40O35185 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bhlhe40O35185 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bhlhe40O35185 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bhlhe40O35185 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Bhlhe40O35185 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Bhlhe40O35185 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bhlhe40O35185 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Bhlhe40O35185 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bhlhe40O35185 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bhlhe40O35185 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bhlhe40O35185 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bhlhe40O35185 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bhlhe40O35185 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bhlhe40O35185 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bhlhe40O35185 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bhlhe40O35185 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bhlhe40O35185 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bhlhe40O35185 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Bhlhe40O35185 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Bhlhe40O35185 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Bhlhe40O35185 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Bhlhe40O35185 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Bhlhe40O35185 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Bhlhe40O35185 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Bhlhe40O35185 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Bhlhe40O35185 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Bhlhe40O35185 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms