Protein–RNA interactions for Protein: O35182

Smad6, Mothers against decapentaplegic homolog 6, mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad6O35182 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smad6O35182 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smad6O35182 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smad6O35182 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smad6O35182 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smad6O35182 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smad6O35182 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smad6O35182 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smad6O35182 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smad6O35182 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smad6O35182 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smad6O35182 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smad6O35182 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smad6O35182 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smad6O35182 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smad6O35182 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smad6O35182 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smad6O35182 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smad6O35182 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smad6O35182 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smad6O35182 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Smad6O35182 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smad6O35182 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Smad6O35182 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smad6O35182 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smad6O35182 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smad6O35182 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smad6O35182 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smad6O35182 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smad6O35182 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smad6O35182 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smad6O35182 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smad6O35182 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smad6O35182 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smad6O35182 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smad6O35182 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smad6O35182 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smad6O35182 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smad6O35182 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smad6O35182 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smad6O35182 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smad6O35182 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smad6O35182 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smad6O35182 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smad6O35182 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smad6O35182 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smad6O35182 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Smad6O35182 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smad6O35182 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smad6O35182 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smad6O35182 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smad6O35182 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smad6O35182 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smad6O35182 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smad6O35182 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smad6O35182 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smad6O35182 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smad6O35182 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smad6O35182 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smad6O35182 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smad6O35182 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smad6O35182 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smad6O35182 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smad6O35182 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Smad6O35182 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Smad6O35182 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smad6O35182 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smad6O35182 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smad6O35182 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smad6O35182 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smad6O35182 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smad6O35182 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smad6O35182 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smad6O35182 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smad6O35182 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smad6O35182 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Smad6O35182 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Smad6O35182 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Smad6O35182 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smad6O35182 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Smad6O35182 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Smad6O35182 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smad6O35182 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smad6O35182 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Smad6O35182 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smad6O35182 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smad6O35182 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smad6O35182 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smad6O35182 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smad6O35182 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smad6O35182 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Smad6O35182 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smad6O35182 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smad6O35182 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smad6O35182 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smad6O35182 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smad6O35182 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smad6O35182 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smad6O35182 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smad6O35182 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms