Protein–RNA interactions for Protein: O35054

Cldn4, Claudin-4, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn4O35054 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cldn4O35054 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cldn4O35054 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cldn4O35054 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cldn4O35054 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cldn4O35054 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cldn4O35054 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cldn4O35054 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cldn4O35054 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cldn4O35054 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cldn4O35054 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cldn4O35054 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cldn4O35054 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cldn4O35054 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cldn4O35054 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cldn4O35054 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cldn4O35054 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cldn4O35054 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cldn4O35054 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cldn4O35054 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cldn4O35054 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cldn4O35054 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cldn4O35054 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Cldn4O35054 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cldn4O35054 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cldn4O35054 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cldn4O35054 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cldn4O35054 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cldn4O35054 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cldn4O35054 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cldn4O35054 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cldn4O35054 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cldn4O35054 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cldn4O35054 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cldn4O35054 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cldn4O35054 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cldn4O35054 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cldn4O35054 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cldn4O35054 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cldn4O35054 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cldn4O35054 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cldn4O35054 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cldn4O35054 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cldn4O35054 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cldn4O35054 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cldn4O35054 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cldn4O35054 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cldn4O35054 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cldn4O35054 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cldn4O35054 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cldn4O35054 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cldn4O35054 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cldn4O35054 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cldn4O35054 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cldn4O35054 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Cldn4O35054 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
Cldn4O35054 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Cldn4O35054 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cldn4O35054 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cldn4O35054 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cldn4O35054 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cldn4O35054 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cldn4O35054 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cldn4O35054 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Cldn4O35054 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Cldn4O35054 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cldn4O35054 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Cldn4O35054 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Cldn4O35054 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cldn4O35054 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cldn4O35054 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Cldn4O35054 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cldn4O35054 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cldn4O35054 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Cldn4O35054 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cldn4O35054 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cldn4O35054 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cldn4O35054 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cldn4O35054 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cldn4O35054 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Cldn4O35054 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cldn4O35054 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cldn4O35054 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cldn4O35054 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cldn4O35054 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cldn4O35054 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cldn4O35054 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cldn4O35054 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cldn4O35054 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cldn4O35054 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cldn4O35054 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cldn4O35054 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cldn4O35054 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cldn4O35054 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cldn4O35054 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Cldn4O35054 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Cldn4O35054 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cldn4O35054 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cldn4O35054 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cldn4O35054 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
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