Protein–RNA interactions for Protein: O08983

Hps1, Hermansky-Pudlak syndrome 1 protein homolog, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps1O08983 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hps1O08983 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hps1O08983 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hps1O08983 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hps1O08983 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hps1O08983 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hps1O08983 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hps1O08983 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hps1O08983 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hps1O08983 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hps1O08983 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hps1O08983 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hps1O08983 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hps1O08983 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hps1O08983 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Hps1O08983 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hps1O08983 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hps1O08983 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hps1O08983 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hps1O08983 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hps1O08983 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hps1O08983 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hps1O08983 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hps1O08983 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hps1O08983 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hps1O08983 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hps1O08983 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hps1O08983 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hps1O08983 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hps1O08983 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hps1O08983 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hps1O08983 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hps1O08983 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hps1O08983 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hps1O08983 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hps1O08983 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hps1O08983 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hps1O08983 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hps1O08983 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hps1O08983 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hps1O08983 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hps1O08983 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hps1O08983 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hps1O08983 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hps1O08983 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hps1O08983 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hps1O08983 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hps1O08983 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hps1O08983 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hps1O08983 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hps1O08983 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hps1O08983 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hps1O08983 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hps1O08983 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Hps1O08983 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Hps1O08983 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hps1O08983 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Hps1O08983 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hps1O08983 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hps1O08983 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hps1O08983 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hps1O08983 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hps1O08983 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hps1O08983 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hps1O08983 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hps1O08983 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hps1O08983 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hps1O08983 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hps1O08983 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hps1O08983 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hps1O08983 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hps1O08983 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hps1O08983 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hps1O08983 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hps1O08983 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hps1O08983 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hps1O08983 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hps1O08983 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hps1O08983 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hps1O08983 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hps1O08983 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Hps1O08983 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hps1O08983 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Hps1O08983 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hps1O08983 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hps1O08983 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hps1O08983 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hps1O08983 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hps1O08983 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hps1O08983 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hps1O08983 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hps1O08983 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hps1O08983 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hps1O08983 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hps1O08983 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hps1O08983 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hps1O08983 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hps1O08983 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hps1O08983 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hps1O08983 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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