Protein–RNA interactions for Protein: O08750

Nfil3, Nuclear factor interleukin-3-regulated protein, mousemouse

Predictions only

Length 462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nfil3O08750 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nfil3O08750 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nfil3O08750 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nfil3O08750 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nfil3O08750 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nfil3O08750 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nfil3O08750 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Nfil3O08750 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Nfil3O08750 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Nfil3O08750 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nfil3O08750 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nfil3O08750 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nfil3O08750 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nfil3O08750 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nfil3O08750 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nfil3O08750 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nfil3O08750 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nfil3O08750 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nfil3O08750 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nfil3O08750 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nfil3O08750 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nfil3O08750 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nfil3O08750 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nfil3O08750 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Nfil3O08750 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nfil3O08750 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nfil3O08750 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nfil3O08750 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nfil3O08750 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nfil3O08750 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nfil3O08750 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nfil3O08750 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nfil3O08750 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nfil3O08750 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nfil3O08750 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nfil3O08750 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nfil3O08750 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nfil3O08750 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nfil3O08750 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nfil3O08750 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nfil3O08750 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nfil3O08750 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nfil3O08750 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Nfil3O08750 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Nfil3O08750 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Nfil3O08750 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nfil3O08750 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nfil3O08750 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nfil3O08750 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nfil3O08750 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nfil3O08750 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nfil3O08750 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Nfil3O08750 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nfil3O08750 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nfil3O08750 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nfil3O08750 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nfil3O08750 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nfil3O08750 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nfil3O08750 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nfil3O08750 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Nfil3O08750 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Nfil3O08750 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nfil3O08750 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nfil3O08750 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nfil3O08750 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nfil3O08750 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nfil3O08750 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nfil3O08750 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nfil3O08750 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nfil3O08750 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nfil3O08750 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nfil3O08750 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nfil3O08750 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nfil3O08750 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nfil3O08750 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Nfil3O08750 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Nfil3O08750 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nfil3O08750 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nfil3O08750 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nfil3O08750 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nfil3O08750 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nfil3O08750 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nfil3O08750 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nfil3O08750 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nfil3O08750 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nfil3O08750 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nfil3O08750 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nfil3O08750 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nfil3O08750 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nfil3O08750 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nfil3O08750 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nfil3O08750 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nfil3O08750 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nfil3O08750 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nfil3O08750 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nfil3O08750 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nfil3O08750 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nfil3O08750 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nfil3O08750 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nfil3O08750 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms