Protein–RNA interactions for Protein: O08540

Msmb, Beta-microseminoprotein, mousemouse

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MsmbO08540 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
MsmbO08540 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
MsmbO08540 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
MsmbO08540 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
MsmbO08540 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
MsmbO08540 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
MsmbO08540 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
MsmbO08540 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
MsmbO08540 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
MsmbO08540 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
MsmbO08540 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
MsmbO08540 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
MsmbO08540 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
MsmbO08540 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
MsmbO08540 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
MsmbO08540 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
MsmbO08540 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
MsmbO08540 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
MsmbO08540 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
MsmbO08540 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
MsmbO08540 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
MsmbO08540 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
MsmbO08540 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
MsmbO08540 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
MsmbO08540 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
MsmbO08540 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
MsmbO08540 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
MsmbO08540 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
MsmbO08540 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
MsmbO08540 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
MsmbO08540 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
MsmbO08540 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
MsmbO08540 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
MsmbO08540 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
MsmbO08540 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
MsmbO08540 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
MsmbO08540 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
MsmbO08540 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
MsmbO08540 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
MsmbO08540 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
MsmbO08540 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
MsmbO08540 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
MsmbO08540 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
MsmbO08540 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
MsmbO08540 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
MsmbO08540 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
MsmbO08540 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
MsmbO08540 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
MsmbO08540 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
MsmbO08540 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
MsmbO08540 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
MsmbO08540 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
MsmbO08540 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
MsmbO08540 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
MsmbO08540 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
MsmbO08540 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
MsmbO08540 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
MsmbO08540 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
MsmbO08540 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
MsmbO08540 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
MsmbO08540 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
MsmbO08540 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
MsmbO08540 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
MsmbO08540 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
MsmbO08540 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
MsmbO08540 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
MsmbO08540 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
MsmbO08540 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
MsmbO08540 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
MsmbO08540 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
MsmbO08540 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
MsmbO08540 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
MsmbO08540 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
MsmbO08540 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
MsmbO08540 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
MsmbO08540 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
MsmbO08540 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
MsmbO08540 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
MsmbO08540 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
MsmbO08540 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
MsmbO08540 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
MsmbO08540 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
MsmbO08540 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
MsmbO08540 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
MsmbO08540 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
MsmbO08540 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
MsmbO08540 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
MsmbO08540 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
MsmbO08540 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
MsmbO08540 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
MsmbO08540 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
MsmbO08540 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
MsmbO08540 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
MsmbO08540 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
MsmbO08540 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
MsmbO08540 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
MsmbO08540 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
MsmbO08540 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
MsmbO08540 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
MsmbO08540 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
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