Protein–RNA interactions for Protein: L7N257

BC117090, cDNA sequence BC1179090, mousemouse

Predictions only

Length 96 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC117090L7N257 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
BC117090L7N257 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
BC117090L7N257 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
BC117090L7N257 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
BC117090L7N257 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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BC117090L7N257 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
BC117090L7N257 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
BC117090L7N257 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
BC117090L7N257 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
BC117090L7N257 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
BC117090L7N257 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
BC117090L7N257 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
BC117090L7N257 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
BC117090L7N257 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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BC117090L7N257 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
BC117090L7N257 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
BC117090L7N257 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
BC117090L7N257 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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BC117090L7N257 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
BC117090L7N257 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
BC117090L7N257 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
BC117090L7N257 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
BC117090L7N257 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
BC117090L7N257 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
BC117090L7N257 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
BC117090L7N257 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
BC117090L7N257 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
BC117090L7N257 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
BC117090L7N257 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
BC117090L7N257 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
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BC117090L7N257 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
BC117090L7N257 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
BC117090L7N257 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
BC117090L7N257 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
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BC117090L7N257 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
BC117090L7N257 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
BC117090L7N257 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
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BC117090L7N257 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
BC117090L7N257 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
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BC117090L7N257 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
BC117090L7N257 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
BC117090L7N257 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
BC117090L7N257 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
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BC117090L7N257 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
BC117090L7N257 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
BC117090L7N257 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
BC117090L7N257 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
BC117090L7N257 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
BC117090L7N257 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
BC117090L7N257 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
BC117090L7N257 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
BC117090L7N257 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
BC117090L7N257 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
BC117090L7N257 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
BC117090L7N257 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
BC117090L7N257 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
BC117090L7N257 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
BC117090L7N257 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
BC117090L7N257 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
BC117090L7N257 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
BC117090L7N257 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
BC117090L7N257 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
BC117090L7N257 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
BC117090L7N257 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
BC117090L7N257 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
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BC117090L7N257 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
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