Protein–RNA interactions for Protein: J3QPW6

1700122O11Rik, MCG53587, mousemouse

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700122O11RikJ3QPW6 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
1700122O11RikJ3QPW6 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
1700122O11RikJ3QPW6 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
1700122O11RikJ3QPW6 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
1700122O11RikJ3QPW6 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
1700122O11RikJ3QPW6 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
1700122O11RikJ3QPW6 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
1700122O11RikJ3QPW6 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
1700122O11RikJ3QPW6 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
1700122O11RikJ3QPW6 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
1700122O11RikJ3QPW6 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
1700122O11RikJ3QPW6 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
1700122O11RikJ3QPW6 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
1700122O11RikJ3QPW6 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
1700122O11RikJ3QPW6 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
1700122O11RikJ3QPW6 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
1700122O11RikJ3QPW6 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
1700122O11RikJ3QPW6 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
1700122O11RikJ3QPW6 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
1700122O11RikJ3QPW6 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
1700122O11RikJ3QPW6 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
1700122O11RikJ3QPW6 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
1700122O11RikJ3QPW6 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
1700122O11RikJ3QPW6 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
1700122O11RikJ3QPW6 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
1700122O11RikJ3QPW6 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
1700122O11RikJ3QPW6 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
1700122O11RikJ3QPW6 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
1700122O11RikJ3QPW6 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
1700122O11RikJ3QPW6 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
1700122O11RikJ3QPW6 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
1700122O11RikJ3QPW6 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
1700122O11RikJ3QPW6 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
1700122O11RikJ3QPW6 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
1700122O11RikJ3QPW6 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
1700122O11RikJ3QPW6 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
1700122O11RikJ3QPW6 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
1700122O11RikJ3QPW6 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
1700122O11RikJ3QPW6 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
1700122O11RikJ3QPW6 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
1700122O11RikJ3QPW6 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
1700122O11RikJ3QPW6 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
1700122O11RikJ3QPW6 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
1700122O11RikJ3QPW6 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
1700122O11RikJ3QPW6 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
1700122O11RikJ3QPW6 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
1700122O11RikJ3QPW6 D030068K23Rik-201ENSMUST00000180382 2617 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
1700122O11RikJ3QPW6 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
1700122O11RikJ3QPW6 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
1700122O11RikJ3QPW6 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
1700122O11RikJ3QPW6 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
1700122O11RikJ3QPW6 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
1700122O11RikJ3QPW6 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
1700122O11RikJ3QPW6 Olfr1428-203ENSMUST00000214103 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
1700122O11RikJ3QPW6 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
1700122O11RikJ3QPW6 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
1700122O11RikJ3QPW6 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
1700122O11RikJ3QPW6 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
1700122O11RikJ3QPW6 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
1700122O11RikJ3QPW6 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
1700122O11RikJ3QPW6 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
1700122O11RikJ3QPW6 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
1700122O11RikJ3QPW6 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
1700122O11RikJ3QPW6 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
1700122O11RikJ3QPW6 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
1700122O11RikJ3QPW6 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
1700122O11RikJ3QPW6 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
1700122O11RikJ3QPW6 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
1700122O11RikJ3QPW6 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
1700122O11RikJ3QPW6 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
1700122O11RikJ3QPW6 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
1700122O11RikJ3QPW6 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
1700122O11RikJ3QPW6 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
1700122O11RikJ3QPW6 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
1700122O11RikJ3QPW6 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
1700122O11RikJ3QPW6 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
1700122O11RikJ3QPW6 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
1700122O11RikJ3QPW6 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
1700122O11RikJ3QPW6 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
1700122O11RikJ3QPW6 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
1700122O11RikJ3QPW6 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
1700122O11RikJ3QPW6 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
1700122O11RikJ3QPW6 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
1700122O11RikJ3QPW6 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
1700122O11RikJ3QPW6 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
1700122O11RikJ3QPW6 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
1700122O11RikJ3QPW6 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
1700122O11RikJ3QPW6 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
1700122O11RikJ3QPW6 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
1700122O11RikJ3QPW6 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
1700122O11RikJ3QPW6 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
1700122O11RikJ3QPW6 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
1700122O11RikJ3QPW6 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
1700122O11RikJ3QPW6 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
1700122O11RikJ3QPW6 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
1700122O11RikJ3QPW6 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
1700122O11RikJ3QPW6 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
1700122O11RikJ3QPW6 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
1700122O11RikJ3QPW6 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
1700122O11RikJ3QPW6 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms