Protein–RNA interactions for Protein: J3QPE5

Gm5849, Predicted gene 5849, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5849J3QPE5 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm5849J3QPE5 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm5849J3QPE5 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm5849J3QPE5 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm5849J3QPE5 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm5849J3QPE5 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm5849J3QPE5 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm5849J3QPE5 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm5849J3QPE5 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm5849J3QPE5 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm5849J3QPE5 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm5849J3QPE5 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm5849J3QPE5 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm5849J3QPE5 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm5849J3QPE5 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm5849J3QPE5 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm5849J3QPE5 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm5849J3QPE5 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm5849J3QPE5 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm5849J3QPE5 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm5849J3QPE5 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm5849J3QPE5 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm5849J3QPE5 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm5849J3QPE5 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm5849J3QPE5 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm5849J3QPE5 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm5849J3QPE5 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm5849J3QPE5 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm5849J3QPE5 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm5849J3QPE5 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm5849J3QPE5 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm5849J3QPE5 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm5849J3QPE5 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm5849J3QPE5 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm5849J3QPE5 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm5849J3QPE5 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm5849J3QPE5 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm5849J3QPE5 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm5849J3QPE5 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm5849J3QPE5 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm5849J3QPE5 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm5849J3QPE5 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm5849J3QPE5 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm5849J3QPE5 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm5849J3QPE5 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm5849J3QPE5 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm5849J3QPE5 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm5849J3QPE5 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm5849J3QPE5 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm5849J3QPE5 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm5849J3QPE5 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm5849J3QPE5 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm5849J3QPE5 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm5849J3QPE5 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm5849J3QPE5 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm5849J3QPE5 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm5849J3QPE5 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm5849J3QPE5 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm5849J3QPE5 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm5849J3QPE5 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm5849J3QPE5 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm5849J3QPE5 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm5849J3QPE5 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm5849J3QPE5 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm5849J3QPE5 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm5849J3QPE5 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm5849J3QPE5 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm5849J3QPE5 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm5849J3QPE5 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm5849J3QPE5 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm5849J3QPE5 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm5849J3QPE5 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm5849J3QPE5 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm5849J3QPE5 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm5849J3QPE5 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm5849J3QPE5 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm5849J3QPE5 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm5849J3QPE5 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm5849J3QPE5 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm5849J3QPE5 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm5849J3QPE5 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm5849J3QPE5 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm5849J3QPE5 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm5849J3QPE5 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm5849J3QPE5 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm5849J3QPE5 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm5849J3QPE5 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm5849J3QPE5 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm5849J3QPE5 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm5849J3QPE5 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm5849J3QPE5 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm5849J3QPE5 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm5849J3QPE5 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm5849J3QPE5 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm5849J3QPE5 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm5849J3QPE5 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm5849J3QPE5 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm5849J3QPE5 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm5849J3QPE5 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm5849J3QPE5 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms