Protein–RNA interactions for Protein: J3QNV7

Gm10428, Predicted gene 10428, mousemouse

Predictions only

Length 132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm10428J3QNV7 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm10428J3QNV7 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm10428J3QNV7 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm10428J3QNV7 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm10428J3QNV7 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm10428J3QNV7 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm10428J3QNV7 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm10428J3QNV7 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm10428J3QNV7 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm10428J3QNV7 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm10428J3QNV7 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm10428J3QNV7 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm10428J3QNV7 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm10428J3QNV7 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm10428J3QNV7 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm10428J3QNV7 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm10428J3QNV7 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm10428J3QNV7 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm10428J3QNV7 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm10428J3QNV7 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm10428J3QNV7 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm10428J3QNV7 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm10428J3QNV7 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm10428J3QNV7 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm10428J3QNV7 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm10428J3QNV7 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm10428J3QNV7 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm10428J3QNV7 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm10428J3QNV7 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm10428J3QNV7 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm10428J3QNV7 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm10428J3QNV7 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm10428J3QNV7 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm10428J3QNV7 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm10428J3QNV7 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm10428J3QNV7 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm10428J3QNV7 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm10428J3QNV7 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm10428J3QNV7 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm10428J3QNV7 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm10428J3QNV7 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm10428J3QNV7 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm10428J3QNV7 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm10428J3QNV7 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm10428J3QNV7 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm10428J3QNV7 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm10428J3QNV7 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm10428J3QNV7 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm10428J3QNV7 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm10428J3QNV7 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm10428J3QNV7 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm10428J3QNV7 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm10428J3QNV7 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm10428J3QNV7 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm10428J3QNV7 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm10428J3QNV7 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm10428J3QNV7 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm10428J3QNV7 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm10428J3QNV7 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm10428J3QNV7 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm10428J3QNV7 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm10428J3QNV7 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm10428J3QNV7 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm10428J3QNV7 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm10428J3QNV7 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm10428J3QNV7 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm10428J3QNV7 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm10428J3QNV7 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm10428J3QNV7 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm10428J3QNV7 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm10428J3QNV7 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm10428J3QNV7 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm10428J3QNV7 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm10428J3QNV7 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm10428J3QNV7 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm10428J3QNV7 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm10428J3QNV7 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm10428J3QNV7 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm10428J3QNV7 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm10428J3QNV7 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm10428J3QNV7 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm10428J3QNV7 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm10428J3QNV7 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm10428J3QNV7 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm10428J3QNV7 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm10428J3QNV7 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm10428J3QNV7 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm10428J3QNV7 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm10428J3QNV7 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm10428J3QNV7 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm10428J3QNV7 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm10428J3QNV7 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm10428J3QNV7 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm10428J3QNV7 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm10428J3QNV7 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm10428J3QNV7 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm10428J3QNV7 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm10428J3QNV7 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm10428J3QNV7 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm10428J3QNV7 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms