Protein–RNA interactions for Protein: J3QN17

Gm20918, Predicted gene, 20918, mousemouse

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Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20918J3QN17 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm20918J3QN17 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm20918J3QN17 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm20918J3QN17 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm20918J3QN17 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm20918J3QN17 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm20918J3QN17 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm20918J3QN17 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm20918J3QN17 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm20918J3QN17 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm20918J3QN17 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm20918J3QN17 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm20918J3QN17 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm20918J3QN17 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm20918J3QN17 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm20918J3QN17 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm20918J3QN17 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm20918J3QN17 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm20918J3QN17 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm20918J3QN17 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm20918J3QN17 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm20918J3QN17 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm20918J3QN17 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm20918J3QN17 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm20918J3QN17 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm20918J3QN17 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm20918J3QN17 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm20918J3QN17 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm20918J3QN17 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm20918J3QN17 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm20918J3QN17 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm20918J3QN17 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm20918J3QN17 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm20918J3QN17 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm20918J3QN17 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm20918J3QN17 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm20918J3QN17 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm20918J3QN17 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm20918J3QN17 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm20918J3QN17 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm20918J3QN17 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm20918J3QN17 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm20918J3QN17 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm20918J3QN17 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm20918J3QN17 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm20918J3QN17 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm20918J3QN17 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm20918J3QN17 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm20918J3QN17 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm20918J3QN17 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm20918J3QN17 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm20918J3QN17 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm20918J3QN17 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm20918J3QN17 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm20918J3QN17 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm20918J3QN17 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm20918J3QN17 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm20918J3QN17 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm20918J3QN17 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm20918J3QN17 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm20918J3QN17 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm20918J3QN17 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm20918J3QN17 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm20918J3QN17 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm20918J3QN17 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm20918J3QN17 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm20918J3QN17 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm20918J3QN17 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm20918J3QN17 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm20918J3QN17 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm20918J3QN17 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm20918J3QN17 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm20918J3QN17 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm20918J3QN17 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm20918J3QN17 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm20918J3QN17 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm20918J3QN17 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm20918J3QN17 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm20918J3QN17 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm20918J3QN17 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm20918J3QN17 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm20918J3QN17 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm20918J3QN17 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm20918J3QN17 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm20918J3QN17 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm20918J3QN17 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm20918J3QN17 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm20918J3QN17 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm20918J3QN17 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm20918J3QN17 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm20918J3QN17 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gm20918J3QN17 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gm20918J3QN17 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gm20918J3QN17 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gm20918J3QN17 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC13.21□□□□□ -0.3
Gm20918J3QN17 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gm20918J3QN17 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gm20918J3QN17 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gm20918J3QN17 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gm20918J3QN17 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
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