Protein–RNA interactions for Protein: J3QMS8

Gm3415, Predicted gene 3415, mousemouse

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Length 315 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3415J3QMS8 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm3415J3QMS8 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm3415J3QMS8 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm3415J3QMS8 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm3415J3QMS8 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm3415J3QMS8 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm3415J3QMS8 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm3415J3QMS8 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm3415J3QMS8 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm3415J3QMS8 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm3415J3QMS8 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm3415J3QMS8 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm3415J3QMS8 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm3415J3QMS8 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm3415J3QMS8 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm3415J3QMS8 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
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Gm3415J3QMS8 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm3415J3QMS8 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm3415J3QMS8 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm3415J3QMS8 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm3415J3QMS8 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm3415J3QMS8 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm3415J3QMS8 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm3415J3QMS8 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm3415J3QMS8 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm3415J3QMS8 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm3415J3QMS8 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm3415J3QMS8 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm3415J3QMS8 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm3415J3QMS8 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm3415J3QMS8 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm3415J3QMS8 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm3415J3QMS8 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm3415J3QMS8 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
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Gm3415J3QMS8 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
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Gm3415J3QMS8 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
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Gm3415J3QMS8 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm3415J3QMS8 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm3415J3QMS8 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm3415J3QMS8 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
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Gm3415J3QMS8 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
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Gm3415J3QMS8 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm3415J3QMS8 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm3415J3QMS8 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
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Gm3415J3QMS8 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm3415J3QMS8 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
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Gm3415J3QMS8 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm3415J3QMS8 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
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Gm3415J3QMS8 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm3415J3QMS8 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm3415J3QMS8 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm3415J3QMS8 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm3415J3QMS8 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm3415J3QMS8 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm3415J3QMS8 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm3415J3QMS8 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm3415J3QMS8 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm3415J3QMS8 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm3415J3QMS8 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm3415J3QMS8 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm3415J3QMS8 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm3415J3QMS8 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm3415J3QMS8 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm3415J3QMS8 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm3415J3QMS8 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm3415J3QMS8 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
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