Protein–RNA interactions for Protein: J3QMQ6

Gm3336, Predicted gene 3336, mousemouse

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Length 198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3336J3QMQ6 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
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Gm3336J3QMQ6 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm3336J3QMQ6 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm3336J3QMQ6 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm3336J3QMQ6 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm3336J3QMQ6 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm3336J3QMQ6 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm3336J3QMQ6 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm3336J3QMQ6 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm3336J3QMQ6 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm3336J3QMQ6 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm3336J3QMQ6 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm3336J3QMQ6 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm3336J3QMQ6 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm3336J3QMQ6 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm3336J3QMQ6 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm3336J3QMQ6 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm3336J3QMQ6 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm3336J3QMQ6 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm3336J3QMQ6 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm3336J3QMQ6 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm3336J3QMQ6 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm3336J3QMQ6 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm3336J3QMQ6 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm3336J3QMQ6 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm3336J3QMQ6 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm3336J3QMQ6 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm3336J3QMQ6 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm3336J3QMQ6 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm3336J3QMQ6 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm3336J3QMQ6 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm3336J3QMQ6 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm3336J3QMQ6 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm3336J3QMQ6 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm3336J3QMQ6 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm3336J3QMQ6 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm3336J3QMQ6 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm3336J3QMQ6 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm3336J3QMQ6 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm3336J3QMQ6 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm3336J3QMQ6 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm3336J3QMQ6 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm3336J3QMQ6 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm3336J3QMQ6 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm3336J3QMQ6 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm3336J3QMQ6 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
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Gm3336J3QMQ6 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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Gm3336J3QMQ6 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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Gm3336J3QMQ6 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm3336J3QMQ6 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm3336J3QMQ6 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm3336J3QMQ6 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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Gm3336J3QMQ6 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Gm3336J3QMQ6 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm3336J3QMQ6 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm3336J3QMQ6 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm3336J3QMQ6 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Gm3336J3QMQ6 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm3336J3QMQ6 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm3336J3QMQ6 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm3336J3QMQ6 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm3336J3QMQ6 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm3336J3QMQ6 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm3336J3QMQ6 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm3336J3QMQ6 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm3336J3QMQ6 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm3336J3QMQ6 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm3336J3QMQ6 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm3336J3QMQ6 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm3336J3QMQ6 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm3336J3QMQ6 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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