Protein–RNA interactions for Protein: J3KMP5

Gm21897, Predicted gene, 21897, mousemouse

Predictions only

Length 500 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21897J3KMP5 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm21897J3KMP5 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm21897J3KMP5 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm21897J3KMP5 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm21897J3KMP5 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm21897J3KMP5 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm21897J3KMP5 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm21897J3KMP5 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm21897J3KMP5 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm21897J3KMP5 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm21897J3KMP5 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm21897J3KMP5 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm21897J3KMP5 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm21897J3KMP5 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm21897J3KMP5 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm21897J3KMP5 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm21897J3KMP5 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm21897J3KMP5 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm21897J3KMP5 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm21897J3KMP5 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm21897J3KMP5 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm21897J3KMP5 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm21897J3KMP5 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm21897J3KMP5 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm21897J3KMP5 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm21897J3KMP5 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm21897J3KMP5 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm21897J3KMP5 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm21897J3KMP5 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm21897J3KMP5 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm21897J3KMP5 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm21897J3KMP5 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm21897J3KMP5 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm21897J3KMP5 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm21897J3KMP5 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm21897J3KMP5 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm21897J3KMP5 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm21897J3KMP5 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm21897J3KMP5 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm21897J3KMP5 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm21897J3KMP5 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm21897J3KMP5 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm21897J3KMP5 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm21897J3KMP5 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm21897J3KMP5 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm21897J3KMP5 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm21897J3KMP5 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm21897J3KMP5 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm21897J3KMP5 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm21897J3KMP5 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm21897J3KMP5 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm21897J3KMP5 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm21897J3KMP5 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm21897J3KMP5 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm21897J3KMP5 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm21897J3KMP5 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm21897J3KMP5 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm21897J3KMP5 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm21897J3KMP5 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm21897J3KMP5 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm21897J3KMP5 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm21897J3KMP5 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm21897J3KMP5 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm21897J3KMP5 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm21897J3KMP5 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm21897J3KMP5 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm21897J3KMP5 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm21897J3KMP5 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm21897J3KMP5 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm21897J3KMP5 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm21897J3KMP5 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm21897J3KMP5 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm21897J3KMP5 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm21897J3KMP5 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm21897J3KMP5 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm21897J3KMP5 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm21897J3KMP5 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm21897J3KMP5 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm21897J3KMP5 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm21897J3KMP5 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm21897J3KMP5 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm21897J3KMP5 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm21897J3KMP5 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm21897J3KMP5 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm21897J3KMP5 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm21897J3KMP5 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm21897J3KMP5 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm21897J3KMP5 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm21897J3KMP5 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm21897J3KMP5 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm21897J3KMP5 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm21897J3KMP5 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm21897J3KMP5 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm21897J3KMP5 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm21897J3KMP5 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm21897J3KMP5 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm21897J3KMP5 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm21897J3KMP5 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm21897J3KMP5 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm21897J3KMP5 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.9 ms