Protein–RNA interactions for Protein: J3KMM7

A630095N17Rik, RIKEN cDNA A630095N17 gene, mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A630095N17RikJ3KMM7 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
A630095N17RikJ3KMM7 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
A630095N17RikJ3KMM7 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
A630095N17RikJ3KMM7 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
A630095N17RikJ3KMM7 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
A630095N17RikJ3KMM7 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
A630095N17RikJ3KMM7 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
A630095N17RikJ3KMM7 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
A630095N17RikJ3KMM7 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
A630095N17RikJ3KMM7 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
A630095N17RikJ3KMM7 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
A630095N17RikJ3KMM7 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
A630095N17RikJ3KMM7 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
A630095N17RikJ3KMM7 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
A630095N17RikJ3KMM7 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
A630095N17RikJ3KMM7 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
A630095N17RikJ3KMM7 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
A630095N17RikJ3KMM7 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
A630095N17RikJ3KMM7 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
A630095N17RikJ3KMM7 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
A630095N17RikJ3KMM7 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
A630095N17RikJ3KMM7 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
A630095N17RikJ3KMM7 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
A630095N17RikJ3KMM7 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
A630095N17RikJ3KMM7 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
A630095N17RikJ3KMM7 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
A630095N17RikJ3KMM7 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
A630095N17RikJ3KMM7 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
A630095N17RikJ3KMM7 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
A630095N17RikJ3KMM7 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
A630095N17RikJ3KMM7 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
A630095N17RikJ3KMM7 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
A630095N17RikJ3KMM7 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
A630095N17RikJ3KMM7 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
A630095N17RikJ3KMM7 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
A630095N17RikJ3KMM7 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
A630095N17RikJ3KMM7 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
A630095N17RikJ3KMM7 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
A630095N17RikJ3KMM7 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
A630095N17RikJ3KMM7 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
A630095N17RikJ3KMM7 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
A630095N17RikJ3KMM7 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
A630095N17RikJ3KMM7 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
A630095N17RikJ3KMM7 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
A630095N17RikJ3KMM7 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
A630095N17RikJ3KMM7 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
A630095N17RikJ3KMM7 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
A630095N17RikJ3KMM7 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
A630095N17RikJ3KMM7 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
A630095N17RikJ3KMM7 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
A630095N17RikJ3KMM7 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
A630095N17RikJ3KMM7 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
A630095N17RikJ3KMM7 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
A630095N17RikJ3KMM7 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
A630095N17RikJ3KMM7 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
A630095N17RikJ3KMM7 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
A630095N17RikJ3KMM7 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
A630095N17RikJ3KMM7 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
A630095N17RikJ3KMM7 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
A630095N17RikJ3KMM7 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
A630095N17RikJ3KMM7 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
A630095N17RikJ3KMM7 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
A630095N17RikJ3KMM7 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
A630095N17RikJ3KMM7 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
A630095N17RikJ3KMM7 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
A630095N17RikJ3KMM7 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
A630095N17RikJ3KMM7 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
A630095N17RikJ3KMM7 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
A630095N17RikJ3KMM7 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
A630095N17RikJ3KMM7 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
A630095N17RikJ3KMM7 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
A630095N17RikJ3KMM7 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
A630095N17RikJ3KMM7 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
A630095N17RikJ3KMM7 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
A630095N17RikJ3KMM7 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
A630095N17RikJ3KMM7 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
A630095N17RikJ3KMM7 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
A630095N17RikJ3KMM7 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
A630095N17RikJ3KMM7 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
A630095N17RikJ3KMM7 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
A630095N17RikJ3KMM7 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
A630095N17RikJ3KMM7 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
A630095N17RikJ3KMM7 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
A630095N17RikJ3KMM7 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
A630095N17RikJ3KMM7 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
A630095N17RikJ3KMM7 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
A630095N17RikJ3KMM7 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
A630095N17RikJ3KMM7 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
A630095N17RikJ3KMM7 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
A630095N17RikJ3KMM7 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
A630095N17RikJ3KMM7 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
A630095N17RikJ3KMM7 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
A630095N17RikJ3KMM7 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
A630095N17RikJ3KMM7 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
A630095N17RikJ3KMM7 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
A630095N17RikJ3KMM7 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
A630095N17RikJ3KMM7 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
A630095N17RikJ3KMM7 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
A630095N17RikJ3KMM7 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
A630095N17RikJ3KMM7 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms