Protein–RNA interactions for Protein: H3BIW7

Gm29394, Predicted gene 29394, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm29394H3BIW7 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm29394H3BIW7 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm29394H3BIW7 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm29394H3BIW7 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm29394H3BIW7 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm29394H3BIW7 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm29394H3BIW7 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm29394H3BIW7 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm29394H3BIW7 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm29394H3BIW7 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm29394H3BIW7 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm29394H3BIW7 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm29394H3BIW7 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm29394H3BIW7 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm29394H3BIW7 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm29394H3BIW7 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm29394H3BIW7 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm29394H3BIW7 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm29394H3BIW7 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm29394H3BIW7 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm29394H3BIW7 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm29394H3BIW7 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm29394H3BIW7 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm29394H3BIW7 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm29394H3BIW7 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm29394H3BIW7 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm29394H3BIW7 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm29394H3BIW7 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm29394H3BIW7 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm29394H3BIW7 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm29394H3BIW7 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm29394H3BIW7 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm29394H3BIW7 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm29394H3BIW7 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm29394H3BIW7 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm29394H3BIW7 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm29394H3BIW7 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm29394H3BIW7 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm29394H3BIW7 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm29394H3BIW7 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm29394H3BIW7 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm29394H3BIW7 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm29394H3BIW7 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm29394H3BIW7 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm29394H3BIW7 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm29394H3BIW7 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm29394H3BIW7 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm29394H3BIW7 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm29394H3BIW7 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm29394H3BIW7 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm29394H3BIW7 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm29394H3BIW7 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm29394H3BIW7 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm29394H3BIW7 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm29394H3BIW7 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm29394H3BIW7 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm29394H3BIW7 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm29394H3BIW7 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm29394H3BIW7 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm29394H3BIW7 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm29394H3BIW7 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm29394H3BIW7 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm29394H3BIW7 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm29394H3BIW7 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm29394H3BIW7 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm29394H3BIW7 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm29394H3BIW7 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm29394H3BIW7 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm29394H3BIW7 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm29394H3BIW7 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm29394H3BIW7 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm29394H3BIW7 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm29394H3BIW7 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm29394H3BIW7 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm29394H3BIW7 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm29394H3BIW7 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm29394H3BIW7 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm29394H3BIW7 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm29394H3BIW7 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm29394H3BIW7 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm29394H3BIW7 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm29394H3BIW7 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm29394H3BIW7 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm29394H3BIW7 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm29394H3BIW7 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm29394H3BIW7 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm29394H3BIW7 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm29394H3BIW7 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm29394H3BIW7 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm29394H3BIW7 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm29394H3BIW7 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm29394H3BIW7 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm29394H3BIW7 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm29394H3BIW7 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm29394H3BIW7 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm29394H3BIW7 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm29394H3BIW7 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm29394H3BIW7 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm29394H3BIW7 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm29394H3BIW7 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms