Protein–RNA interactions for Protein: G5E8Z2

Taf4b, Transcription initiation factor TFIID subunit 4B, mousemouse

Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf4bG5E8Z2 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Taf4bG5E8Z2 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Taf4bG5E8Z2 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Taf4bG5E8Z2 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Taf4bG5E8Z2 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Taf4bG5E8Z2 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Taf4bG5E8Z2 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Taf4bG5E8Z2 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Taf4bG5E8Z2 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Taf4bG5E8Z2 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Taf4bG5E8Z2 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Taf4bG5E8Z2 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Taf4bG5E8Z2 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Taf4bG5E8Z2 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Taf4bG5E8Z2 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Taf4bG5E8Z2 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Taf4bG5E8Z2 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Taf4bG5E8Z2 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Taf4bG5E8Z2 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Taf4bG5E8Z2 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Taf4bG5E8Z2 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Taf4bG5E8Z2 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Taf4bG5E8Z2 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Taf4bG5E8Z2 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Taf4bG5E8Z2 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Taf4bG5E8Z2 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Taf4bG5E8Z2 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Taf4bG5E8Z2 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Taf4bG5E8Z2 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Taf4bG5E8Z2 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Taf4bG5E8Z2 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Taf4bG5E8Z2 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Taf4bG5E8Z2 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Taf4bG5E8Z2 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Taf4bG5E8Z2 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Taf4bG5E8Z2 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Taf4bG5E8Z2 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Taf4bG5E8Z2 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Taf4bG5E8Z2 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Taf4bG5E8Z2 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Taf4bG5E8Z2 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Taf4bG5E8Z2 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Taf4bG5E8Z2 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Taf4bG5E8Z2 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Taf4bG5E8Z2 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Taf4bG5E8Z2 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Taf4bG5E8Z2 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Taf4bG5E8Z2 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Taf4bG5E8Z2 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Taf4bG5E8Z2 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Taf4bG5E8Z2 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Taf4bG5E8Z2 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Taf4bG5E8Z2 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Taf4bG5E8Z2 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Taf4bG5E8Z2 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Taf4bG5E8Z2 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Taf4bG5E8Z2 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Taf4bG5E8Z2 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Taf4bG5E8Z2 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Taf4bG5E8Z2 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Taf4bG5E8Z2 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Taf4bG5E8Z2 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Taf4bG5E8Z2 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Taf4bG5E8Z2 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Taf4bG5E8Z2 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Taf4bG5E8Z2 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Taf4bG5E8Z2 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Taf4bG5E8Z2 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Taf4bG5E8Z2 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Taf4bG5E8Z2 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Taf4bG5E8Z2 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Taf4bG5E8Z2 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Taf4bG5E8Z2 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Taf4bG5E8Z2 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Taf4bG5E8Z2 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Taf4bG5E8Z2 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Taf4bG5E8Z2 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Taf4bG5E8Z2 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Taf4bG5E8Z2 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Taf4bG5E8Z2 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Taf4bG5E8Z2 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Taf4bG5E8Z2 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Taf4bG5E8Z2 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Taf4bG5E8Z2 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Taf4bG5E8Z2 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Taf4bG5E8Z2 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Taf4bG5E8Z2 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Taf4bG5E8Z2 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Taf4bG5E8Z2 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Taf4bG5E8Z2 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Taf4bG5E8Z2 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Taf4bG5E8Z2 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Taf4bG5E8Z2 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Taf4bG5E8Z2 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Taf4bG5E8Z2 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Taf4bG5E8Z2 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Taf4bG5E8Z2 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Taf4bG5E8Z2 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Taf4bG5E8Z2 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Taf4bG5E8Z2 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
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