Protein–RNA interactions for Protein: G5E8V9

Arfip1, ADP-ribosylation factor-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arfip1G5E8V9 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Arfip1G5E8V9 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Arfip1G5E8V9 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Arfip1G5E8V9 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Arfip1G5E8V9 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Arfip1G5E8V9 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Arfip1G5E8V9 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Arfip1G5E8V9 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Arfip1G5E8V9 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Arfip1G5E8V9 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Arfip1G5E8V9 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Arfip1G5E8V9 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Arfip1G5E8V9 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Arfip1G5E8V9 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Arfip1G5E8V9 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Arfip1G5E8V9 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Arfip1G5E8V9 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Arfip1G5E8V9 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Arfip1G5E8V9 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Arfip1G5E8V9 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Arfip1G5E8V9 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Arfip1G5E8V9 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Arfip1G5E8V9 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Arfip1G5E8V9 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Arfip1G5E8V9 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Arfip1G5E8V9 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Arfip1G5E8V9 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Arfip1G5E8V9 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Arfip1G5E8V9 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Arfip1G5E8V9 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Arfip1G5E8V9 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Arfip1G5E8V9 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Arfip1G5E8V9 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Arfip1G5E8V9 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Arfip1G5E8V9 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Arfip1G5E8V9 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Arfip1G5E8V9 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Arfip1G5E8V9 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Arfip1G5E8V9 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Arfip1G5E8V9 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Arfip1G5E8V9 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Arfip1G5E8V9 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Arfip1G5E8V9 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Arfip1G5E8V9 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Arfip1G5E8V9 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Arfip1G5E8V9 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Arfip1G5E8V9 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Arfip1G5E8V9 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Arfip1G5E8V9 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Arfip1G5E8V9 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Arfip1G5E8V9 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Arfip1G5E8V9 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Arfip1G5E8V9 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Arfip1G5E8V9 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Arfip1G5E8V9 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Arfip1G5E8V9 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Arfip1G5E8V9 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Arfip1G5E8V9 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Arfip1G5E8V9 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Arfip1G5E8V9 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Arfip1G5E8V9 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Arfip1G5E8V9 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Arfip1G5E8V9 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Arfip1G5E8V9 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Arfip1G5E8V9 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Arfip1G5E8V9 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Arfip1G5E8V9 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Arfip1G5E8V9 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Arfip1G5E8V9 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Arfip1G5E8V9 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Arfip1G5E8V9 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Arfip1G5E8V9 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Arfip1G5E8V9 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Arfip1G5E8V9 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Arfip1G5E8V9 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Arfip1G5E8V9 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Arfip1G5E8V9 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Arfip1G5E8V9 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Arfip1G5E8V9 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Arfip1G5E8V9 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Arfip1G5E8V9 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Arfip1G5E8V9 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Arfip1G5E8V9 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Arfip1G5E8V9 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Arfip1G5E8V9 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Arfip1G5E8V9 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Arfip1G5E8V9 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Arfip1G5E8V9 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Arfip1G5E8V9 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Arfip1G5E8V9 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Arfip1G5E8V9 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Arfip1G5E8V9 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Arfip1G5E8V9 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Arfip1G5E8V9 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Arfip1G5E8V9 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Arfip1G5E8V9 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Arfip1G5E8V9 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Arfip1G5E8V9 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Arfip1G5E8V9 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Arfip1G5E8V9 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.9 ms