Protein–RNA interactions for Protein: G5E8K1

2610028H24Rik, RIKEN cDNA 2610028H24, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2610028H24RikG5E8K1 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
2610028H24RikG5E8K1 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
2610028H24RikG5E8K1 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
2610028H24RikG5E8K1 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
2610028H24RikG5E8K1 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
2610028H24RikG5E8K1 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
2610028H24RikG5E8K1 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
2610028H24RikG5E8K1 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
2610028H24RikG5E8K1 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
2610028H24RikG5E8K1 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
2610028H24RikG5E8K1 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
2610028H24RikG5E8K1 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
2610028H24RikG5E8K1 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
2610028H24RikG5E8K1 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
2610028H24RikG5E8K1 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
2610028H24RikG5E8K1 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
2610028H24RikG5E8K1 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
2610028H24RikG5E8K1 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
2610028H24RikG5E8K1 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
2610028H24RikG5E8K1 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
2610028H24RikG5E8K1 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
2610028H24RikG5E8K1 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
2610028H24RikG5E8K1 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
2610028H24RikG5E8K1 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
2610028H24RikG5E8K1 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
2610028H24RikG5E8K1 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
2610028H24RikG5E8K1 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
2610028H24RikG5E8K1 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
2610028H24RikG5E8K1 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
2610028H24RikG5E8K1 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
2610028H24RikG5E8K1 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
2610028H24RikG5E8K1 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
2610028H24RikG5E8K1 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
2610028H24RikG5E8K1 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
2610028H24RikG5E8K1 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
2610028H24RikG5E8K1 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
2610028H24RikG5E8K1 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
2610028H24RikG5E8K1 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
2610028H24RikG5E8K1 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
2610028H24RikG5E8K1 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
2610028H24RikG5E8K1 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
2610028H24RikG5E8K1 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
2610028H24RikG5E8K1 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
2610028H24RikG5E8K1 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
2610028H24RikG5E8K1 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
2610028H24RikG5E8K1 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
2610028H24RikG5E8K1 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
2610028H24RikG5E8K1 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
2610028H24RikG5E8K1 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
2610028H24RikG5E8K1 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
2610028H24RikG5E8K1 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
2610028H24RikG5E8K1 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
2610028H24RikG5E8K1 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
2610028H24RikG5E8K1 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
2610028H24RikG5E8K1 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
2610028H24RikG5E8K1 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
2610028H24RikG5E8K1 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
2610028H24RikG5E8K1 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
2610028H24RikG5E8K1 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
2610028H24RikG5E8K1 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
2610028H24RikG5E8K1 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
2610028H24RikG5E8K1 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
2610028H24RikG5E8K1 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
2610028H24RikG5E8K1 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
2610028H24RikG5E8K1 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
2610028H24RikG5E8K1 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
2610028H24RikG5E8K1 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
2610028H24RikG5E8K1 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
2610028H24RikG5E8K1 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
2610028H24RikG5E8K1 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
2610028H24RikG5E8K1 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
2610028H24RikG5E8K1 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
2610028H24RikG5E8K1 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
2610028H24RikG5E8K1 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
2610028H24RikG5E8K1 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
2610028H24RikG5E8K1 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
2610028H24RikG5E8K1 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
2610028H24RikG5E8K1 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
2610028H24RikG5E8K1 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
2610028H24RikG5E8K1 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
2610028H24RikG5E8K1 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
2610028H24RikG5E8K1 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
2610028H24RikG5E8K1 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
2610028H24RikG5E8K1 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
2610028H24RikG5E8K1 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
2610028H24RikG5E8K1 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
2610028H24RikG5E8K1 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
2610028H24RikG5E8K1 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
2610028H24RikG5E8K1 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
2610028H24RikG5E8K1 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
2610028H24RikG5E8K1 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
2610028H24RikG5E8K1 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
2610028H24RikG5E8K1 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
2610028H24RikG5E8K1 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
2610028H24RikG5E8K1 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
2610028H24RikG5E8K1 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
2610028H24RikG5E8K1 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
2610028H24RikG5E8K1 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
2610028H24RikG5E8K1 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
2610028H24RikG5E8K1 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms