Protein–RNA interactions for Protein: G3X9M3

Hmgxb3, HMG box domain-containing 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgxb3G3X9M3 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hmgxb3G3X9M3 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hmgxb3G3X9M3 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hmgxb3G3X9M3 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hmgxb3G3X9M3 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hmgxb3G3X9M3 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hmgxb3G3X9M3 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hmgxb3G3X9M3 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hmgxb3G3X9M3 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hmgxb3G3X9M3 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hmgxb3G3X9M3 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hmgxb3G3X9M3 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hmgxb3G3X9M3 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hmgxb3G3X9M3 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hmgxb3G3X9M3 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hmgxb3G3X9M3 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hmgxb3G3X9M3 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hmgxb3G3X9M3 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hmgxb3G3X9M3 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hmgxb3G3X9M3 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hmgxb3G3X9M3 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hmgxb3G3X9M3 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hmgxb3G3X9M3 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hmgxb3G3X9M3 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hmgxb3G3X9M3 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hmgxb3G3X9M3 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hmgxb3G3X9M3 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hmgxb3G3X9M3 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hmgxb3G3X9M3 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Hmgxb3G3X9M3 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Hmgxb3G3X9M3 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Hmgxb3G3X9M3 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hmgxb3G3X9M3 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hmgxb3G3X9M3 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hmgxb3G3X9M3 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hmgxb3G3X9M3 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hmgxb3G3X9M3 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hmgxb3G3X9M3 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hmgxb3G3X9M3 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hmgxb3G3X9M3 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hmgxb3G3X9M3 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hmgxb3G3X9M3 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hmgxb3G3X9M3 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hmgxb3G3X9M3 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hmgxb3G3X9M3 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hmgxb3G3X9M3 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hmgxb3G3X9M3 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hmgxb3G3X9M3 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hmgxb3G3X9M3 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hmgxb3G3X9M3 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hmgxb3G3X9M3 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Hmgxb3G3X9M3 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hmgxb3G3X9M3 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hmgxb3G3X9M3 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hmgxb3G3X9M3 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hmgxb3G3X9M3 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hmgxb3G3X9M3 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hmgxb3G3X9M3 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hmgxb3G3X9M3 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hmgxb3G3X9M3 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hmgxb3G3X9M3 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hmgxb3G3X9M3 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hmgxb3G3X9M3 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hmgxb3G3X9M3 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hmgxb3G3X9M3 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hmgxb3G3X9M3 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hmgxb3G3X9M3 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hmgxb3G3X9M3 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hmgxb3G3X9M3 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hmgxb3G3X9M3 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hmgxb3G3X9M3 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hmgxb3G3X9M3 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hmgxb3G3X9M3 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hmgxb3G3X9M3 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hmgxb3G3X9M3 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hmgxb3G3X9M3 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Hmgxb3G3X9M3 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hmgxb3G3X9M3 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hmgxb3G3X9M3 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hmgxb3G3X9M3 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hmgxb3G3X9M3 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hmgxb3G3X9M3 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hmgxb3G3X9M3 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hmgxb3G3X9M3 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hmgxb3G3X9M3 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hmgxb3G3X9M3 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hmgxb3G3X9M3 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hmgxb3G3X9M3 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hmgxb3G3X9M3 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hmgxb3G3X9M3 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hmgxb3G3X9M3 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hmgxb3G3X9M3 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hmgxb3G3X9M3 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hmgxb3G3X9M3 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hmgxb3G3X9M3 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hmgxb3G3X9M3 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hmgxb3G3X9M3 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hmgxb3G3X9M3 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hmgxb3G3X9M3 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hmgxb3G3X9M3 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms