Protein–RNA interactions for Protein: G3UVU6

Gm20517, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 20, mousemouse

Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20517G3UVU6 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Gm20517G3UVU6 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Gm20517G3UVU6 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Gm20517G3UVU6 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Gm20517G3UVU6 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Gm20517G3UVU6 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm20517G3UVU6 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm20517G3UVU6 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm20517G3UVU6 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm20517G3UVU6 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm20517G3UVU6 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm20517G3UVU6 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm20517G3UVU6 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm20517G3UVU6 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm20517G3UVU6 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm20517G3UVU6 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm20517G3UVU6 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm20517G3UVU6 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm20517G3UVU6 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm20517G3UVU6 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm20517G3UVU6 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm20517G3UVU6 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm20517G3UVU6 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm20517G3UVU6 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm20517G3UVU6 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm20517G3UVU6 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm20517G3UVU6 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm20517G3UVU6 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm20517G3UVU6 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm20517G3UVU6 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm20517G3UVU6 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm20517G3UVU6 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm20517G3UVU6 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm20517G3UVU6 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm20517G3UVU6 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm20517G3UVU6 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm20517G3UVU6 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm20517G3UVU6 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm20517G3UVU6 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm20517G3UVU6 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm20517G3UVU6 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm20517G3UVU6 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm20517G3UVU6 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm20517G3UVU6 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm20517G3UVU6 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm20517G3UVU6 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm20517G3UVU6 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm20517G3UVU6 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm20517G3UVU6 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm20517G3UVU6 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm20517G3UVU6 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm20517G3UVU6 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm20517G3UVU6 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm20517G3UVU6 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm20517G3UVU6 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm20517G3UVU6 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm20517G3UVU6 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm20517G3UVU6 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm20517G3UVU6 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm20517G3UVU6 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm20517G3UVU6 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm20517G3UVU6 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm20517G3UVU6 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm20517G3UVU6 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm20517G3UVU6 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm20517G3UVU6 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm20517G3UVU6 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm20517G3UVU6 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm20517G3UVU6 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm20517G3UVU6 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm20517G3UVU6 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm20517G3UVU6 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm20517G3UVU6 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm20517G3UVU6 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm20517G3UVU6 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm20517G3UVU6 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm20517G3UVU6 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm20517G3UVU6 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm20517G3UVU6 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm20517G3UVU6 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm20517G3UVU6 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm20517G3UVU6 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm20517G3UVU6 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm20517G3UVU6 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm20517G3UVU6 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm20517G3UVU6 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm20517G3UVU6 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm20517G3UVU6 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm20517G3UVU6 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm20517G3UVU6 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm20517G3UVU6 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm20517G3UVU6 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm20517G3UVU6 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm20517G3UVU6 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm20517G3UVU6 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm20517G3UVU6 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm20517G3UVU6 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm20517G3UVU6 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm20517G3UVU6 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm20517G3UVU6 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms