Protein–RNA interactions for Protein: F7CCV5

Gm3443, Predicted gene 3443, mousemouse

Predictions only

Length 94 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3443F7CCV5 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm3443F7CCV5 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm3443F7CCV5 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm3443F7CCV5 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm3443F7CCV5 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm3443F7CCV5 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm3443F7CCV5 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm3443F7CCV5 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm3443F7CCV5 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm3443F7CCV5 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm3443F7CCV5 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm3443F7CCV5 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm3443F7CCV5 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm3443F7CCV5 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm3443F7CCV5 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm3443F7CCV5 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm3443F7CCV5 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm3443F7CCV5 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm3443F7CCV5 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm3443F7CCV5 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm3443F7CCV5 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm3443F7CCV5 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm3443F7CCV5 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm3443F7CCV5 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm3443F7CCV5 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm3443F7CCV5 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm3443F7CCV5 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm3443F7CCV5 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm3443F7CCV5 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm3443F7CCV5 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm3443F7CCV5 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm3443F7CCV5 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm3443F7CCV5 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm3443F7CCV5 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm3443F7CCV5 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm3443F7CCV5 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm3443F7CCV5 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm3443F7CCV5 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm3443F7CCV5 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm3443F7CCV5 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm3443F7CCV5 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm3443F7CCV5 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm3443F7CCV5 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm3443F7CCV5 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm3443F7CCV5 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm3443F7CCV5 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm3443F7CCV5 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm3443F7CCV5 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm3443F7CCV5 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm3443F7CCV5 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm3443F7CCV5 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm3443F7CCV5 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm3443F7CCV5 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm3443F7CCV5 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm3443F7CCV5 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm3443F7CCV5 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm3443F7CCV5 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm3443F7CCV5 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm3443F7CCV5 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm3443F7CCV5 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm3443F7CCV5 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm3443F7CCV5 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm3443F7CCV5 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm3443F7CCV5 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm3443F7CCV5 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm3443F7CCV5 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm3443F7CCV5 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm3443F7CCV5 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm3443F7CCV5 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm3443F7CCV5 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm3443F7CCV5 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm3443F7CCV5 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm3443F7CCV5 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm3443F7CCV5 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm3443F7CCV5 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm3443F7CCV5 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm3443F7CCV5 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm3443F7CCV5 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm3443F7CCV5 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm3443F7CCV5 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm3443F7CCV5 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm3443F7CCV5 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm3443F7CCV5 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm3443F7CCV5 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm3443F7CCV5 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm3443F7CCV5 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm3443F7CCV5 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm3443F7CCV5 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm3443F7CCV5 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm3443F7CCV5 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm3443F7CCV5 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm3443F7CCV5 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm3443F7CCV5 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm3443F7CCV5 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm3443F7CCV5 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm3443F7CCV5 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm3443F7CCV5 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm3443F7CCV5 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm3443F7CCV5 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm3443F7CCV5 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms