Protein–RNA interactions for Protein: F6VCN9

Gm5861, Predicted gene 5861 (Fragment), mousemouse

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Length 180 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5861F6VCN9 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm5861F6VCN9 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm5861F6VCN9 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm5861F6VCN9 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm5861F6VCN9 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm5861F6VCN9 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm5861F6VCN9 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm5861F6VCN9 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm5861F6VCN9 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm5861F6VCN9 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
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Gm5861F6VCN9 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm5861F6VCN9 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm5861F6VCN9 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm5861F6VCN9 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm5861F6VCN9 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm5861F6VCN9 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm5861F6VCN9 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm5861F6VCN9 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm5861F6VCN9 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm5861F6VCN9 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm5861F6VCN9 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm5861F6VCN9 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
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Gm5861F6VCN9 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm5861F6VCN9 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm5861F6VCN9 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm5861F6VCN9 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm5861F6VCN9 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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Gm5861F6VCN9 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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Gm5861F6VCN9 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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Gm5861F6VCN9 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm5861F6VCN9 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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Gm5861F6VCN9 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm5861F6VCN9 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm5861F6VCN9 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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Gm5861F6VCN9 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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Gm5861F6VCN9 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm5861F6VCN9 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm5861F6VCN9 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm5861F6VCN9 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gm5861F6VCN9 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gm5861F6VCN9 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gm5861F6VCN9 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
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Gm5861F6VCN9 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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