Protein–RNA interactions for Protein: F6SG70

Gm28374, Predicted gene 28374 (Fragment), mousemouse

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Length 93 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28374F6SG70 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Gm28374F6SG70 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Gm28374F6SG70 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Gm28374F6SG70 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Gm28374F6SG70 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Gm28374F6SG70 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Gm28374F6SG70 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Gm28374F6SG70 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm28374F6SG70 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm28374F6SG70 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm28374F6SG70 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm28374F6SG70 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm28374F6SG70 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm28374F6SG70 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm28374F6SG70 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm28374F6SG70 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm28374F6SG70 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm28374F6SG70 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm28374F6SG70 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm28374F6SG70 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm28374F6SG70 Gm42651-201ENSMUST00000199851 1339 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm28374F6SG70 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm28374F6SG70 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm28374F6SG70 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm28374F6SG70 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm28374F6SG70 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm28374F6SG70 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm28374F6SG70 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm28374F6SG70 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm28374F6SG70 Dleu2-205ENSMUST00000182325 463 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm28374F6SG70 Dleu2-212ENSMUST00000183079 535 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm28374F6SG70 E330011O21Rik-205ENSMUST00000211317 1062 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm28374F6SG70 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm28374F6SG70 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm28374F6SG70 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm28374F6SG70 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm28374F6SG70 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm28374F6SG70 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm28374F6SG70 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm28374F6SG70 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm28374F6SG70 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm28374F6SG70 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm28374F6SG70 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm28374F6SG70 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm28374F6SG70 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm28374F6SG70 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm28374F6SG70 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm28374F6SG70 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm28374F6SG70 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm28374F6SG70 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm28374F6SG70 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm28374F6SG70 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm28374F6SG70 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm28374F6SG70 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm28374F6SG70 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm28374F6SG70 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm28374F6SG70 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm28374F6SG70 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm28374F6SG70 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm28374F6SG70 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm28374F6SG70 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm28374F6SG70 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm28374F6SG70 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm28374F6SG70 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm28374F6SG70 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm28374F6SG70 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm28374F6SG70 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm28374F6SG70 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm28374F6SG70 4933416E03Rik-201ENSMUST00000133091 1126 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm28374F6SG70 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm28374F6SG70 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm28374F6SG70 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm28374F6SG70 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm28374F6SG70 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm28374F6SG70 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm28374F6SG70 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm28374F6SG70 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm28374F6SG70 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm28374F6SG70 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm28374F6SG70 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm28374F6SG70 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm28374F6SG70 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm28374F6SG70 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm28374F6SG70 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm28374F6SG70 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm28374F6SG70 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm28374F6SG70 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm28374F6SG70 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm28374F6SG70 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm28374F6SG70 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm28374F6SG70 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm28374F6SG70 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm28374F6SG70 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm28374F6SG70 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm28374F6SG70 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm28374F6SG70 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm28374F6SG70 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm28374F6SG70 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm28374F6SG70 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm28374F6SG70 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
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