Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6B2

Ccdc85c, Coiled-coil domain-containing protein 85C, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc85cE9Q6B2 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc85cE9Q6B2 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc85cE9Q6B2 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc85cE9Q6B2 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc85cE9Q6B2 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc85cE9Q6B2 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc85cE9Q6B2 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc85cE9Q6B2 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc85cE9Q6B2 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc85cE9Q6B2 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc85cE9Q6B2 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc85cE9Q6B2 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc85cE9Q6B2 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc85cE9Q6B2 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc85cE9Q6B2 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc85cE9Q6B2 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc85cE9Q6B2 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc85cE9Q6B2 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc85cE9Q6B2 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc85cE9Q6B2 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc85cE9Q6B2 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc85cE9Q6B2 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc85cE9Q6B2 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc85cE9Q6B2 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc85cE9Q6B2 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc85cE9Q6B2 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc85cE9Q6B2 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc85cE9Q6B2 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc85cE9Q6B2 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc85cE9Q6B2 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc85cE9Q6B2 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc85cE9Q6B2 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc85cE9Q6B2 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc85cE9Q6B2 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc85cE9Q6B2 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc85cE9Q6B2 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc85cE9Q6B2 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc85cE9Q6B2 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc85cE9Q6B2 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc85cE9Q6B2 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc85cE9Q6B2 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc85cE9Q6B2 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc85cE9Q6B2 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc85cE9Q6B2 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc85cE9Q6B2 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc85cE9Q6B2 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc85cE9Q6B2 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc85cE9Q6B2 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc85cE9Q6B2 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc85cE9Q6B2 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc85cE9Q6B2 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc85cE9Q6B2 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc85cE9Q6B2 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc85cE9Q6B2 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc85cE9Q6B2 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc85cE9Q6B2 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc85cE9Q6B2 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc85cE9Q6B2 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc85cE9Q6B2 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc85cE9Q6B2 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc85cE9Q6B2 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc85cE9Q6B2 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc85cE9Q6B2 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc85cE9Q6B2 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc85cE9Q6B2 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc85cE9Q6B2 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc85cE9Q6B2 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc85cE9Q6B2 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc85cE9Q6B2 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc85cE9Q6B2 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc85cE9Q6B2 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc85cE9Q6B2 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc85cE9Q6B2 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc85cE9Q6B2 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc85cE9Q6B2 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc85cE9Q6B2 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc85cE9Q6B2 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc85cE9Q6B2 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc85cE9Q6B2 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc85cE9Q6B2 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc85cE9Q6B2 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc85cE9Q6B2 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc85cE9Q6B2 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc85cE9Q6B2 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc85cE9Q6B2 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc85cE9Q6B2 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc85cE9Q6B2 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc85cE9Q6B2 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc85cE9Q6B2 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc85cE9Q6B2 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc85cE9Q6B2 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc85cE9Q6B2 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc85cE9Q6B2 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc85cE9Q6B2 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc85cE9Q6B2 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc85cE9Q6B2 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc85cE9Q6B2 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc85cE9Q6B2 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc85cE9Q6B2 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc85cE9Q6B2 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms