Protein–RNA interactions for Protein: E9Q612

Ptpro, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase O, mousemouse

Predictions only

Length 1,226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtproE9Q612 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PtproE9Q612 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PtproE9Q612 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
PtproE9Q612 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
PtproE9Q612 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PtproE9Q612 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PtproE9Q612 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PtproE9Q612 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PtproE9Q612 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PtproE9Q612 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PtproE9Q612 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PtproE9Q612 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PtproE9Q612 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PtproE9Q612 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PtproE9Q612 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PtproE9Q612 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PtproE9Q612 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PtproE9Q612 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PtproE9Q612 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PtproE9Q612 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PtproE9Q612 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PtproE9Q612 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PtproE9Q612 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PtproE9Q612 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PtproE9Q612 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PtproE9Q612 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PtproE9Q612 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PtproE9Q612 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PtproE9Q612 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PtproE9Q612 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
PtproE9Q612 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PtproE9Q612 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PtproE9Q612 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PtproE9Q612 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PtproE9Q612 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PtproE9Q612 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PtproE9Q612 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PtproE9Q612 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PtproE9Q612 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PtproE9Q612 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PtproE9Q612 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
PtproE9Q612 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PtproE9Q612 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PtproE9Q612 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PtproE9Q612 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PtproE9Q612 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PtproE9Q612 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PtproE9Q612 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PtproE9Q612 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PtproE9Q612 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PtproE9Q612 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PtproE9Q612 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PtproE9Q612 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PtproE9Q612 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PtproE9Q612 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PtproE9Q612 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PtproE9Q612 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PtproE9Q612 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PtproE9Q612 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PtproE9Q612 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PtproE9Q612 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PtproE9Q612 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PtproE9Q612 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PtproE9Q612 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PtproE9Q612 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PtproE9Q612 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PtproE9Q612 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PtproE9Q612 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PtproE9Q612 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PtproE9Q612 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PtproE9Q612 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PtproE9Q612 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PtproE9Q612 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PtproE9Q612 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PtproE9Q612 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
PtproE9Q612 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
PtproE9Q612 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PtproE9Q612 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PtproE9Q612 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PtproE9Q612 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PtproE9Q612 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PtproE9Q612 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PtproE9Q612 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PtproE9Q612 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PtproE9Q612 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PtproE9Q612 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PtproE9Q612 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PtproE9Q612 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PtproE9Q612 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PtproE9Q612 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PtproE9Q612 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PtproE9Q612 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PtproE9Q612 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PtproE9Q612 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PtproE9Q612 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PtproE9Q612 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PtproE9Q612 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PtproE9Q612 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PtproE9Q612 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PtproE9Q612 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms